Structure分析 Structure分析使用了与进化树和PCA截然不同的算法,所以能够解决后两者不能解决的问...[作者空间]
基本概念 连锁不平衡(LD,linkage disequilibrium)是指 不同基因座(loci)的等位基因(...[作者空间]
要做选择性消除分析,首先就要把如下的理论记住熟记于心。 中性进化假说: 分子水平上,生物的演化或物种的进化并不是自...[作者空间]
基本概念: 基因流(也称基因迁移) 是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质,从而改变群体“基因库”的...[作者空间]
在前面的帖子中介绍了数据的导入和清洗,网络构建的两种方法,模块与性状的关联,这篇文章将介绍如果进行模块可视化。WG...[作者空间]
最近看了一篇综述,粗略翻译一下文献:Padhukasahasram, B. (2014). Inferring a...[作者空间]
网上查了查似乎没有一个完整的从参考基因组reference.fna和注释文件.gff出发,到blastn,再到提取...[作者空间]
转座子参考[http://blog.sciencenet.cn/blog-1509670-1205415.html...[作者空间]
第一步使用bwa将测序结果比对到参考基因组,获得sam格式文件 sam转换为bam并排序 统计测序深度用到的软件是...[作者空间]
上一期,给大家介绍了SnpEff注释数据库。这一期着重介绍SnpEff的命令,最后一期介绍注释结果解析 准备文件已...[作者空间]
根据已有的蛋白库,对从基因组上提取到的蛋白序列进行比对,从而获得相应的信息。 常用的数据库: Nr:NCBI官方非...[作者空间]