教程对应B站：【生信技能树】转录组测序数据分析链接：https://www.bilibili.com/video/...[作者空间]
实验设计 实验目的决定试验方法和途径。试验目的 :获取三阴性乳腺癌的正常组织和癌症组织的基因表达差异情况，比较三阴...[作者空间]
持续更新ing.....最后更新时间：2019/3/8 10:28 AM 1.linux命令 1.1 linux...[作者空间]
RNA-Seq数据标准化方法 oriRNA在RNA-Seq的分析中，我们常用RPKM、FPKM和TPM作为转录组数...[作者空间]
前面RNA-seq分析：从软件安装到富集分析部分已经把转录组全部流程走完了一遍，这次利用RNA-seq(2)-2:...[作者空间]
这部分直接从上部分RNA-seq(9):富集分析(功能注释)的数据而来，当然如果你上部分数据存盘了，这部分直接导入...[作者空间]
从安装软件到富集分析，完整流程链接整理： RNA-seq(1) :用conda安装RNA-seq所需要的工具 RN...[作者空间]
这部分开始进行基本的富集分析，两类 A：差异基因富集分析（不需要表达值，只需要gene name） B: 基因集(...[作者空间]
写在前面： 这部分主要做一些数据可视化，富集分析暂时放下一部分，如果想跳过这里，请直接移步RNA-seq(9):富...[作者空间]
序 走到这一步，似乎顺畅了许多，最主要时间不用花费那么多了。另外，以前曾经处理过不计其数的芯片，挑选差异表达基因，...[作者空间]
任务 1.实现这个功能的软件也很多，还是烦请大家先自己搜索几个教程，入门请统一用htseq-count，对每个样本...[作者空间]
比对软件很多，首先大家去收集一下，因为我们是带大家入门，请统一用hisat2(官网https://ccb.jhu....[作者空间]
1.在 UCSC 下载 hg19 参考基因组；2.从 gencode 数据库下载基因注释文件，并且用 IGV 去查...[作者空间]
把RNA-seq(2)-2下载的sra文件转换为fastq格式的测序文件，并且用fastqc软件测试测序文件的质量...[作者空间]
这节按生信技能树的要求进行数据下载，同时下载一组肝癌数据。文章：AKAP95 regulates splicing...[作者空间]
How to download All Sra data At Once SRA: Sequence Read ...[作者空间]
写在前面: 来自生信技能树《生信必修课之软件安装》学会用包管理工具安装软件 查看变量echo $PATH 用户配置...[作者空间]
