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SnpEff是一款注释变异位点(SNP+InDel+MNP)和预测变异对基因的影响(例如氨基酸变化)的工具。 用法...[作者空间]
检测bam文件的完整度 本来以为有bai文件就说明是完整的,事实上我还是太年轻,最近处理一个 600个病人的肿瘤W...[作者空间]
前言 更多内容,请访问我的 个人博客。 fasta fasta (维基百科)格式是最基本的表示序列信息(核苷酸或者...[作者空间]
下载bowtie2软件后拿到示例数据: 1)统计reads_1.fq 文件中共有多少条序列信息 fq文件的特点是:...[作者空间]
把https://www.jianshu.com/p/c2328c2c83a1下载的sra文件转换为fastq格式...[作者空间]
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当二代测序的原始数据拿到手之后,第一步要做的就是看一看原始reads的质量。常用的工具就是fastqc (http...[作者空间]