单细胞的通路分析 在做单细胞的通路分析的时候,第一就想做GO,KEGG,当然这是对于差异基因,但是单细胞的差异基因...[作者空间]
title: "m6A-LGG-week1"author: "Hannisal"date: "2020/10/3"...[作者空间]
1.评估分类方法的性能 拥有能够度量实用性而不是原始准确度的模型性能评价方法是至关重要的。 3种数据类型评价分类器...[作者空间]
什么是火山图? 火山图其实是一种很形象的叫法,它可以通过关注对象的落点从而直观地展示该对象的所属区域。其通常用于展...[作者空间]
安装配置conda 使用清华源下载sh脚本并安装 下载完成后直接运行脚本文件bash Miniconda3-lat...[作者空间]
1.分类规则原理 if-else逻辑:前件由特征值的特定组合构成,在满足规则的条件下,后件描述用来指定的分类值。 ...[作者空间]
前面介绍了利用Seurat对10x空间转录组数据单个样本进行数据预处理、降维、聚类分析。今天来继续分享怎么整合多个...[作者空间]
1.理解朴素贝叶斯 1)基本概念 依据概率原则进行分类。如天气预测概率。 朴素贝叶斯(Naive Bayes, N...[作者空间]
scRNA基础分析-1:安装包、导入数据、过滤质控 - 简书 scRNA基础分析-2:降维与聚类 - 简书 s...[作者空间]
1.箱线图 Box plots 1.1 语法 geom_boxplot( mapping = NULL, data...[作者空间]
本文首发于我的个人博客, http://xuzhougeng.top/ 往期回顾: 使用ArchR分析单细胞ATA...[作者空间]
Reads:高通量测序平台产生的序列就称为reads。 Contig:拼接软件基于reads之间的overlap区...[作者空间]
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回归分析断断续续、囫囵吞枣、半拉卡机、似懂非懂看了几次了,不过每次都是有点新理解,过段时间一回忆,又一脸懵圈的想,...[作者空间]
CNV 拷贝数变异分析流程 一 .下载文件(略) 二 .注释基因 通过位点把基因位点注释为基因 三 .数据整理合...[作者空间]
一、什么是批次效应 批次效应(batch effect),表示样品在不同批次中处理和测量产生的与试验期间记录的任何...[作者空间]
count normalization的方法 这应该会是一个小系列,我会简单介绍下现在的一些count norma...[作者空间]
基于上游分析获得表达矩阵后,就可以进行差异分析了,最基础的莫过于利用DEseq2包寻找差异基因。学习自b站视频生信...[作者空间]
前言:巧妙的色彩搭配,能够绘制出更具审美价值的图片,令人耳目一新。本文主要讲解比较受欢迎的R包配色方案。 (一):...[作者空间]
很多在线的工具画维恩图很方便,比如(http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venn...[作者空间]