写在前面 初始组装经过基因组纠错（polish）以及去冗余（purge）之后，就可以将其挂载到染色体上，使其由contig/scaffold级别的基因组提升到chromoso...[作者空间]
本期内容为WGDI：用于基因组复制和核型进化分析的工具包 本文发表在Mol Plant期刊上，详情可看文章：WGD...[作者空间]
之前使用的是3D-DNA流程做Hi-C的辅助组装，它的最大优势就是输出结果可以对接下游的JBAT(juicerbo...[作者空间]
该工具主要用于去除基因组重复的序列。 详情请查看githup [https://githup.com/lardo/...[作者空间]
EDTA (Extensive de novo TE Annotator), TE注释工具 整合了几款TE注释工具...[作者空间]
1. 建立项目团体 多机构合作，数据和利益共享。 2. 收集目标基因组信息 考虑的因素：基因组大小、倍性、杂合性、...[作者空间]
简介 SyRI，全称Synteny and Rearrangement Identifier，是一个使用 whol...[作者空间]
籼稻占全世界水稻产量的70%，并且更加具有遗传多样性。籼稻品种珍汕97（ZS97）和明恢63（MH63）是籼稻的两...[作者空间]
下载地址 一：安装 可以conda安装或自己手动安装 除此之外还需要安几个依赖的软件 其中安装RepeatMask...[作者空间]
背景篇 在植物基因组中，I类转座因子，LTR-RT(LTR retrotransposons)是基因组扩张的主要原...[作者空间]
GMAP最早用于讲EST/cDNA序列比对到参考基因组上，可以用于基因组结构注释。后来高通量测序时代，又开发了GS...[作者空间]
