怎么判断测序样本的reads与参考基因组比对,每一个基因的CDS区域与基因主体区域,如果CDS区域大于95%且基因...[作者空间]
基于组装好的基因组,例如某一个基因在该基因组中无注释,需检查是否为注释错误,还是该基因本身缺失。 软件:genbl...[作者空间]
基本思路都是从不同软件的结果通过手动操作转为minimap2的paf格式再转为chain文件,基于chain文件便...[作者空间]
在运行braker2的时候遇到了报错 查看一下安装的biopython版本 由于1.80的版本已经删掉了Alpha...[作者空间]
论文 GENESPACE: syntenic pan-genome annotations for eukaryo...[作者空间]
GATK是一款用于基因组数据分析的软件,其强大的处理引擎和高性能计算功能使其能够承担任何规模的项目。 GATK的功...[作者空间]
Mummer详细介绍转至参考:https://www.jianshu.com/p/2e184e5c15b7[htt...[作者空间]
1 Bedtools:一个强大的基因组算法工具集 Bedtools是由犹他大学昆兰实验室开发的基因组算法工具集,它...[作者空间]
项目背景 对bam文件按多种自定义的划窗来统计区间的测序覆盖度。 我的需求 对于同一个bam文件,根据不同分割条件...[作者空间]
参数: 输出文件格式说明: 82 TTTTCGTATGGTAAAGCCTTGGCCATTTTTGGAGCGTTTT...[作者空间]
如何使用MUMmer比对大片段序列 测序技术刚开始发展的时候,大家得到的序列都是单个基因的长度,所以一般都是逐个基...[作者空间]