思考题1:什么是生物信息学,如何理解其含义?为什么在大规模测序研究中,生物信息学至关重要? 一、生物信息学有三个方...[作者空间]
原本以为毕业了就起飞了,没想到,喵的比没毕业还累...又鸽了仨月,这个小插件到时完善了不少,但是上次承诺的视频还是...[作者空间]
单倍型,是单倍体[https://baike.baidu.com/item/%E5%8D%95%E5%80%8D%...[作者空间]
参考文章:可视化之circular barplot 之前利用WGCNA分析得到了一组感兴趣的基因(WGCNA学习笔...[作者空间]
基本操作 比方说我们读入人类基因组文件 利用BSgenome 对于刚安装R的同学,安装BSgenome可能会报错,...[作者空间]
参考学习资料:https://github.com/cgrace1978/manhplot/MANHATTAN++...[作者空间]
前言 因为以前的分析流程要在Shell 和 R 之间切换,然后可控性还差,有点烦,正好最近有点数据要分析,干脆就重...[作者空间]
注意:版本不同,命令会不一致。一定要用对应的版本。 1.GATK的安装、使用别人的教程腾讯云的教程GATK4数据预...[作者空间]
原文英文链接:ChIP-Seq Workflow Template作者:Daniela Cassol (danie...[作者空间]
目前,GO 注释主要有两种方法:(1)序列相似性比对(BLAST)(2)结构域相似性比对(InterProScan...[作者空间]
小麦的GO富集分析,我使用的是(clusterProfiler),先安装clusterprofiler,我的R版本...[作者空间]
首先最重要的参考链接: [karyoploteR] https://bernatgel.github.io/kar...[作者空间]
可以用网页版做,但有上限2000个基因的限制。所以今天开发一下怎么用R飞一波。 1. 下载STRING数据库中蛋白...[作者空间]
知识的学习没有一蹴而就,没有捷近,扎实的学习是唯一的捷近。 一篇RNA-seq分析流程的综述,全面而详细!深度好文...[作者空间]
测序深度的分布图是很常见的一类图,可用于发现染色体片段或整条染色体的缺失或是重复。如果是缺失,测序时捕获的概率...[作者空间]
挺好的推文,写的是最基本的遗传度计算流程,先存下来,待慢慢改进。"原文链接"如文章“Genome-wide Com...[作者空间]
参考自生信技能树:https://github.com/shenmengyuan/RNA_seq_Biotrain...[作者空间]
数据来源:Cytosolic acetyl-CoA promotes histone acetylationpre...[作者空间]
github地址:https://github.com/seandavi/awesome-single-cell这...[作者空间]
目录MCScanX下载及安装数据准备MCScanX运行及结果Ka & Ks 计算下游画图脚本最后 MCScanX有...[作者空间]