使用DEseq2循环做多组间差异表达分析 当有多组RNA-seq数据时,有时需要对多个组合进行差异表达分析,例如当...[作者空间]
欢迎关注Bioinfor 生信云! 这一期我们来讲讲富集分析。 构建OrgDB OrgDB是bioconducto...[作者空间]
小编写过有关基因名的坑的推文,总结了有关基因名的十大坑,见:。今天为大家推荐一款很不错的基因名转化在线服务器 – ...[作者空间]
做可变剪切分析时,会依次进行基因水平和转录本水平的差异分析,最后通常需要进行ENSEMBL ID和 transcr...[作者空间]
首先是用gffread提取cds序列,蛋白序列,转录本序列 接下来我们利用组合工具来提取mRNA,和gene序列 ...[作者空间]
本篇推文用于新手清晰了解并掌握植物RNAseq数据分析流程 一、测序数据的介绍 测序数据主要有两个来源 1、自测的...[作者空间]
本文是由比利时列日大学Marc HANIKENNE课程整理。陆陆续续花费1个月完成,根据需要做的主要内容分为四个部...[作者空间]
hisat2 构建索引 hisat2 比对 hisat2 比对软件将 reads 比对到参考基因组[https:/...[作者空间]
前言 关于clusterProfiler这个R包就不介绍了,网红教授宣传得很成功,功能也比较强大,主要是做GO和K...[作者空间]
http://www.sthda.com/english/wiki/correlation-test-betwee...[作者空间]
了解PCA降维原理的同志们,一定都知道PCA的核心是在数据的高维空间里面,寻找出合适的一组向量(向量之间相互正交)...[作者空间]
本文摘自:R 语言主成分分析(PCA)实战教程[https://mp.weixin.qq.com/s/uQPCPh...[作者空间]
前言 什么?Excel那么low?! 是的,我是写来救小白的, 大神请点赞后飘开~ 场景——需要知道哪个数据重复了...[作者空间]
前面简单介绍过基因矩阵转置文件格式(* .gmt)[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz...[作者空间]
WGCNA分析过程中,你可以得到edge和node的文件,里面有你某一个module里所有基因相互之间的conne...[作者空间]
1.SAM文件 SAM全称:sequence alignment/map format。BAM是SAM的二进制文件...[作者空间]
莎莎写于2020.5.1学校第一批返校的同学已经解封了,我还在宾馆隔离我今天在这里立个Flag:每天都要写简书✍哈...[作者空间]
一般做完差异基因,或者使用其他方法找到想要的biomarker时,想要知道这些基因的调控网络,或者哪些基因在调控网...[作者空间]
这次偶然发现了处理RNA-seq的新神器,首先附上地址:http://www.bioconductor.org/p...[作者空间]
春节后的第一次写学习笔记,还是要提醒大家没事别聚集、别聚集、别聚集!重要的事情说三遍! 前几天看到公众号里写了GS...[作者空间]