不知道大家有没有印象，其实关于调整ggplot2图形背景，图例，XY轴范围及标签等的问题在我们往期公众号有推文介绍...[作者空间]
Lefse分析 Lefse（LDA Effect Size）分析是一种用于发现和解释高维度数据的基因、通路和分类单...[作者空间]
主成分分析（Principal component analysis，PCA）是将多个存在相关关系的变量，降维为几...[作者空间]
绘图中经常需要对图片进行精细调整，图例的调整尤其重要；本节来详细介绍调整图例的细节 安装R包 安装{tidyver...[作者空间]
本节来介绍如何更改图例中键的形状，每个 geom 都有一个默认的 key_glyph，但可以通过在 geom 调用...[作者空间]
R有自己的计算样本距离(dist)和聚类(hclust)的方法/函数，各自包含多种算法据数据特征选择。另外在生态学...[作者空间]
简介 PCoA分析，即主坐标分析（principal co-ordinates analysis），是一种非约束性...[作者空间]
在数据分析过程中，常常需要把组间的显著性添加到图形中，但是在ggplot2中实现起来略显麻烦，幸运的是，有很多R包...[作者空间]
遇到了一个16S的课题，于是开始认真学习ASV和OTU的差别，顺手整理一下。 扩增子测序和鸟枪法测序已经成为微生物...[作者空间]
系统发育树几乎是基因家族文章的必备图，一个好看的树图的确能给文章增色不少，一般的用户可能只使用MEGA绘图，进阶一...[作者空间]
LEfSe[1]是一种用于发现高维生物标识和揭示基因组特征的软件。包括基因，代谢和分类，用于区别两个或两个以上生物...[作者空间]
数据分析中通常都需要对数据进行统计检验，仿佛加个P值就能显得论文数据更加专业一点，本节不介绍如何计算P值，我们来介...[作者空间]
前言 首先，vst也是基于负二项分布的一种标准化方法我们为什么在大样本数据中需要采用vst的标准化方法呢？这是因为...[作者空间]
简介 优势物种展示。 数据样式：常见丰度表，列为样本，行为物种，交叉区域为各物种在各样本中的丰度。 一般堆叠柱状图...[作者空间]
的方法 标准化和归一化的区别 归一化其实就是标准化的一种方式，只不过归一化是将数据映射到了[0,1]这个区间中。标...[作者空间]
参考文章：1.https://www.jianshu.com/p/c72bb359f050[https://www...[作者空间]
前面介绍了如何使用qiime2训练特征分类器对16s数据进行分类注释，但是由于其占用内存较高，个人电脑难以运行，现...[作者空间]
导读 PICRUSt (Phylogenetic Investigation of Communities by ...[作者空间]
导读 前面介绍过网页版LEfSe的使用方法：用LEfSe寻找组间差异细菌[https://www.jianshu....[作者空间]
