设备 炫龙DC2 CPU i5 8400 台式机cpu 电脑硬件配置 内存 ddr4双通道 16g 硬盘 nvme...[作者空间]
clusterProfiler是业界大神Y叔写的R包,看过了它的绘图就会使人沉迷于其颜值无法自拔。本文很多内容直接...[作者空间]
我们组学大讲堂的《转录组数据自主分析》课程迎来重大更新!11年生信高手重新精心录制,讲解更流畅、更细致、内容更丰富...[作者空间]
前言 这一部分主要涉及常规RNA-seq的数据分析,提到了常见的数据分析流程。 RNA-seq数据分析 用于分析测...[作者空间]
前言 这一部分的内容主要涉及单细胞测序,空间转录组,新生RNA测序,翻译组,RNA-RNA之间相互作用,RNA-蛋...[作者空间]
《RNA sequencing: the teenage years》这篇综述翻译了一下,全篇汉字大约是3万字,比...[作者空间]
「文献」多倍体植物基因组测序组装当前策略 文献地址: Current Strategies of Polyploi...[作者空间]
lz从今天开始希望跟大家分享一些生信的实战,希望与大家一起进步,前段时间应老板的要求自学的转录组的拼接原理,经...[作者空间]
写作之友 基因和基因簇的功能谱 (functional profiles) 的统计学分析及可视化 G Yu, LG...[作者空间]
parseOrthoMclResult.py解析orthoMCL的输出结果,主要是groups.xls文件 获得每...[作者空间]
参考自生信技能树:https://github.com/shenmengyuan/RNA_seq_Biotrain...[作者空间]
============= 1. 作者介绍 ============= 这是一个位于波士顿的癌症研究中心与英国牛津...[作者空间]
既然可以通过Trinity对所有的Reads进行拼接后得到很多的转录本(Transcripts) , 因此很有必要...[作者空间]
这本是三年多之前我发在公众号上的一篇旧文,一些偶然的机会,发现不少朋友也在讨论这个问题,因此我重新做了梳理并发出来...[作者空间]
目录介绍环境配置OrthoMCL使用统计聚类结果最后 介绍 OrthoMCL是一款直系同源基因聚类软件, 它不仅能...[作者空间]
前期的到的基因表达量矩阵,可以得到每个基因的表达量,然而由于我们在做实验过程中的重复(包括技术重复与生物学重复)理...[作者空间]
通过前期的基因定量,我们通过RSEM或者Kallisto这些工具得到了每个基因或者转录本的表达量矩阵。输出的矩阵包...[作者空间]
前面三节,我们得到了Trinity拼接的Fasta 文件(Trinity.fasta)以及通过Bowtie2将Fa...[作者空间]
在第二节中,我们采用了Trinity工具做了转录组数据的拼接,我一共是6个样本6个G的数据量,在我那个设置下跑了接...[作者空间]
Trinity是广泛应用的不依赖基因组的转录组分析工具 我们在这一节中将采用Trinity在服务器端对第一节中获得...[作者空间]