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OrthoMCL .sh 运行完之后的操作

OrthoMCL .sh 运行完之后的操作

作者: 徒唤奈何_c5f0 | 来源:发表于2019-04-14 16:59 被阅读0次

    parseOrthoMclResult.py解析orthoMCL的输出结果,主要是groups.xls文件

    获得每个物种各个基因簇中基因数目的矩阵。

    提取在所有物种中 都只有一个拷贝的基因,提交给工具orthoMclPhyloGenetic.py用于做进化分析。

    提取特定物种特有的基因簇。

    提取多个物种共有相对于其它物种特异的基因簇。

    提取某物种特异扩增或缺失的基因家族。

    parseOrthoMclResult.py

    原文发布于微信公众号 - 生信宝典(Bio_data)

    原文发表时间:2018-06-13

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