parseOrthoMclResult.py解析orthoMCL的输出结果,主要是groups.xls文件
获得每个物种各个基因簇中基因数目的矩阵。
提取在所有物种中 都只有一个拷贝的基因,提交给工具orthoMclPhyloGenetic.py用于做进化分析。
提取特定物种特有的基因簇。
提取多个物种共有相对于其它物种特异的基因簇。
提取某物种特异扩增或缺失的基因家族。
parseOrthoMclResult.py
原文发布于微信公众号 - 生信宝典(Bio_data)
原文发表时间:2018-06-13
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