参考文献：CEL-Seq2: sensitive highly-multiplexed single-cell R...[作者空间]
DropSeq 简介 Drop-seq技术最初由麻省理工学院的McCarroll实验室开发，于2015年首次发表在...[作者空间]
这里准备了一个文件，是要将这个文件中的信息plot到umap图上，文件有3列 今天的目标就是: 将第一列barco...[作者空间]
在2022年还在更新的一款软件 https://www.genome.med.kyoto-u.ac.jp/HLA-...[作者空间]
使用Cellranger vdj 流程能得到一个网页版的报告，如上图样式. 今天将对这几个指标进行解释说明,用于后...[作者空间]
这篇文章是单细胞转录组（scRNAseq）和TCRseq联合分析的一个综述，介绍了目前关于这两种数据联合分析的最新...[作者空间]
MiXCR是一个通用的框架，处理从原始测序数据到定量clonotype的免疫组数据。 支持PE和SE的reads，...[作者空间]
有意思的CITEseq文库结构。 理解CITEseq的文库结构,有助于在分析数据的过程中更好地troublesho...[作者空间]
10x RNAseq数据 在用cellranger 跑完10xRNaseq数据分析后，会生成一个outs目录， 这...[作者空间]
介绍： 这是一个可以自动合并数据的简易脚本 应用场景： 有一批数据有三十几个样本,测序公司返回数据时由于数据量不达...[作者空间]
你将读到以下内容：字典的存储：包括一维字典，二维字典，或多维字典的存储。字典的报错：KeyError，ValueE...[作者空间]
当比较不同细胞的基因表达时，特定基因的read数被用作表达的代理测量。然而，这一指标会受到技术差异的影响，比如样本...[作者空间]
上一篇讲了GenVisR 基因组数据可视化实战 (一)[https://www.jianshu.com/p/bb6...[作者空间]
从高通量基因组技术直观地可视化和解读数据仍然具有挑战性。R中的基因组可视化(GenVisR)试图通过提供高度可定制...[作者空间]
背景： TMB是指肿瘤突变负荷（tumor mutation burden），TMB已显示出作为多种应用的预测性生...[作者空间]
DepthOfCoverage会输出7个文本结果。其中一个是按照interval上的每个碱基，输出一行统计信息，所...[作者空间]
正常细胞中的DNA含量应该比较稳定。肿瘤细胞中DNA含量会增多，恶性肿瘤细胞表现为非整倍体异常增多。测定肿瘤细胞中...[作者空间]
git 路径： https://github.com/AlexanderDilthey/MHC-PRG[https...[作者空间]
一个HLA Allel 可以分成四个字段，再加上最后的修饰后缀，共5个字段，在定义HLA分型结果的分辨率时，会根据...[作者空间]
按照使用手册安装，写的很全，没什么采坑的地方，安装手册非常值得一读。 安装：安装完后还要下载annotation数...[作者空间]
