AnnotSV 记录

作者: 11的雾 | 来源:发表于2022-02-16 21:52 被阅读0次

按照使用手册安装，写的很全，没什么采坑的地方，安装手册非常值得一读。

安装：
安装完后还要下载annotation数据库
make DESTDIR= PREFIX=/software/biosoftware/AnnotSV install-human-annotation

Human annotation installed

将下列数据路径写入到~/.bashrc

export ANNOTSV=/software/biosoftware/AnnotSV/

调用：$ANNOTSV/bin/AnnotSV -h

有以下数据库：

注释bed文件：

sample.SNVs.bed

$AnnotSV/bin/AnnotSV -SVinputFile sample.SNVs.bed

生成结果：

image.png

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