什么是K-mer? mer : 分子生物学领域中意义为:monomeric unit ( mer) :单体单元,相...[作者空间]
我们统一选择p<0.05而且abs(logFC)大于1的基因为显著差异表达基因集,对这个基因集用R包做KEGG/G...[作者空间]
这个步骤推荐在R里面做,载入表达矩阵,然后设置好分组信息,统一用DEseq2进行差异分析,当然也可以走走edgeR...[作者空间]
课程来源于生信技能树:http://www.biotrainee.com/forum.php?mod=viewth...[作者空间]
要求 实现这个功能的软件也很多,还是烦请大家先自己搜索几个教程,入门请统一用htseq-count,对每个样本都会...[作者空间]
欢迎来GitHub上fork,一起进步: https://github.com/xuzhougeng 比对软件很多...[作者空间]
转录组入门(4):了解参考基因组及基因注释在UCSC下载hg19参考基因组,我博客有详细说明,从gencode数据...[作者空间]
需要用安装好的sratoolkit把sra文件转换为fastq格式的测序文件,并且用fastqc软件测试测序文件的...[作者空间]
本系列课程学习的文章是:AKAP95 regulates splicing through scaffolding...[作者空间]
tags: Trimmomatic NGS fastq NGS 原始数据过滤对后续分析至关重要,去除一些无用的序列...[作者空间]
本文转自生信人https://www.shengxin.ren/article/16 1、简介 SRA(Seque...[作者空间]