. 背景 一个朋友问我,如何固定asreml的初始值,现在分为单性状和多性状进行说明。为何要固定初始值:1,由于群...[作者空间]
首先,从心广体胖这个词说起,很多胖胖的人,都是非常开朗、非常逗比的,他们是周围朋友的活宝,因为他们喜欢自嘲加自黑,...[作者空间]
前言 因为本身从事的工作是动植物的选种选配方面的数据分析,涉及到育种值,配合力方面的计算。经常和朋友讨论,如果这一...[作者空间]
关于分群的软件,之前写了structure 2.3.4 软件使用指南,软件虽然有windows版本,但是操作太麻烦...[作者空间]
模拟一套数据, 5个世代, 最后三代有基因型数据, 每个世代400个个体, SNP为50K 1. blupf90构...[作者空间]
软件介绍 基因组选择中, 有时候测量了很多家系,如果想看一下这些家系的分类情况,可以使用软件对其进行分群。一般使用...[作者空间]
软件介绍系列 1. GCTA介绍 在群体遗传中,GCTA中做PCA非常方便, 下面介绍一下GCTA的安装方法. 2...[作者空间]
写在最前面 BLUPF90号称遗传评估领域的三剑客之一(另外另个是 ASREML和DMU), 基因组时代的到来, ...[作者空间]
前言 目前, 基因组选择进入了一个高速发展的阶段, 各种新的算法和模型被提出, 这里对基因组选择的软件进行一个汇总...[作者空间]
目标 这次, 我要实现这个路程图. 目标介绍 第一: 生成1.txt , 2.txt, 3.txt 第二: 向每个...[作者空间]
参考资料 一个稍微复杂的案例 这是另一个snakemake的案例, 之前介绍过通过简单的方法, 使用snakema...[作者空间]
1, snakemake介绍 Snakemake是用Python3写的一个流程化工具, 非常方便. 官网上的例子有...[作者空间]
一: 我的理想 我一直有一个理想, 写博客就舒心的去写, 然后能够在知乎, 简书, csdn, 科学网上任意复制,...[作者空间]
PIBLUP:一款高效处理动植物基因组大数据的GS软件 近期,中国农业大学刘剑锋老师课题组,在Frontiers ...[作者空间]
GPOPSIM软件: https://github.com/SCAU-AnimalGenetics/GPOPSIM...[作者空间]
全基因组选择GS软件: MiXBLUP 2.1介绍 MiXBLUP 2.1 使用系谱信息和基因组信息估计育种值 软...[作者空间]
全基因组选择中交叉验证选择的策略 Assessment of Cross-validation Strategie...[作者空间]
定义基因组选择的最基本思路:在基因组中存在大量遗传标记(SNP),影响性状的所有基因都至少与一个标记紧密连锁。因此...[作者空间]
ASreml VS WOMBAT-文献解析 参考文献 Waheed A, Khan M S. Computing ...[作者空间]
如何在R语言中构建动物模型混合线性模型方程并计算BLUP值 数据 参考书籍:王金玉, 陈国宏. 《数量遗传与动物育...[作者空间]