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数据科学如何助力在线婚配1:表型选择和系谱选择

数据科学如何助力在线婚配1:表型选择和系谱选择

作者: 育种数据分析之放飞自我 | 来源:发表于2019-07-08 23:29 被阅读4次

    前言

    因为本身从事的工作是动植物的选种选配方面的数据分析,涉及到育种值,配合力方面的计算。经常和朋友讨论,如果这一套东西运用到人类上面,会有哪些应用场景呢?
    前提假定:人类婚配的目的是为了繁衍优秀的后代,将自己的基因传承下去。

    1. 表型选择

    动植物育种中,最开始是利用表型进行选择,这种选择方法对于遗传力较高的性状效果明显。人类在婚配选择中,会看对方是否漂亮,是否帅气,这些漂亮和帅气的特点和繁殖性状是紧密相关的,比如身材丰满,意味着哺乳能力较强,身体健壮意味着精力充沛,能够产生健康的后代,体型高大意味着在抢夺食物的体力竞争中更容易取胜等等。这些和生产繁殖紧密相关的表型性状,深深融入了我们的审美观念中,潜意识的推动我们择偶方向。
    因此,漂亮的美女,追求者更多,帅气的男人,更容易择偶。
    关键词:遗传力, 表型选择,繁殖性状

    2. 系谱选择

    表型选择的优势在于对一些遗传力较高的性状选择效果较好,它的缺点是对于一些中低遗传力,效果较差。动植物育种中,开始使用系谱选择,通过追溯系谱的形式来预测两个个体选配后代的表现,比如通过它的父母本,通过它的兄弟姐妹,来预测它的表现。选择方法有半同胞选择,全同胞选择,父本模型,外祖父模型,动物模型等。于是BLUP呼之欲出。。。
    什么是BLUP?
    BLUP是最佳线性无偏预测,是混合线性模型中对随机因子的预测效应值,在计算中,可以考虑亲本之间的亲缘关系,那么无论是半同胞,全同胞都可以计算BLUP值,也可以称为育种值,或者一般配合力。
    人类选种选配时,也在自觉的使用系谱选择,比如介绍对象时,要考虑对方的家庭情况,父母亲戚等信息作为参考,为什么要这样做呢?**因为个体的表型值可能不能遗传下去(环境因素),需要结合其它亲戚的信息进行校正。

    后期写作计划:

    1,基因组选择的可能应用
    根据达官贵人, 首富名人, 建立训练模型, 进行候选群体的预测,
    2,综合育种值与选择指数
    哪些重要的性状是选种选配中需要关注的,各个性状的权重如何分配
    3,中国历朝历代的繁荣与崩溃与基因型在人群分布的关系

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