之前写过ChIP-seq的基础分析：ChIP-seq数据分析（一）：从raw reads到peaks，和此文有很多...[作者空间]
前期文章 一个超简单的转录组项目全过程--iMac+RNA-Seq（一）一个超简单的转录组项目全过程--iMac+...[作者空间]
Motif，模式，pattern，如下。我个人理解为：一组具有类似特征的序列。而在分子序列中，那么就是具有类似分子...[作者空间]
题目：Destin: toolkit for single-cell analysis of chromatin ...[作者空间]
bwa bowtie salmon 直接从fastq到达特异性表达矩阵 subread 备注：需要对应建索引的软件...[作者空间]
学习目标 学习用DiffBind流程评估两个样本间的差异结合区域 用PCA评估样本间的关系 评估不同工具得到的差异...[作者空间]
感兴趣的基因信息包含在bedGraph文件中，下面命令是对其文件格式进行转换，一般进行到bam文件可视化的效果比较...[作者空间]
安装默认使用Conda macs2的基本命令 输出文件包括 为了方便在IGV上查看ChIP-seq的结果和后期的可...[作者空间]
callpeak用法 这是MACS2的主要功能，因为MACS2的目的就是找peak，其他功能都是可有可无，唯独ca...[作者空间]
MEM-ChIP的特性 MEM-ChIP程序可以对你提供的DNA序列进行一系列的motif分析，他特别适合用来分析...[作者空间]
tags： Trimmomatic NGS fastq NGS 原始数据过滤对后续分析至关重要，去除一些无用的序列...[作者空间]
