链接： 包括哪些流程？ 链接：https://nf-co.re/pipelines nascent ：Nascen...[作者空间]
拿到数据后通常需要使用FastQC软件进行质控，认识原始测序数据（fastq data）并查看数据质量怎么样。通过...[作者空间]
慢慢练。记录笔记。这个得到结果很慢，写的不简练从stringtie生成的gtf文件中提取fpkm值。并且将相同基因...[作者空间]
本文首发于博客 喜欢科比的球迷应该熟悉这个词，mamba（曼巴）是科比的绰号，同时曼巴也是眼镜蛇的一种，黑曼巴是世...[作者空间]
写作之友 基因和基因簇的功能谱 (functional profiles) 的统计学分析及可视化 G Yu, LG...[作者空间]
前言 在各个行业都是有行业标准的，这样才能统一规范而方便后面的分析，在生物信息学领域中主要是各种大量序列数据、注释...[作者空间]
这期的BBQ继续，我们来持续关注转录本的分析！ 我们在上期的BBQ（BBQ(生物信息基础问题35，36)：RN...[作者空间]
在一年前，我写过一篇文章，叫做如何从BAM文件中提取fastq，之前也发现了从BAM里面提取Fastq是有些麻烦，...[作者空间]
知识的学习没有一蹴而就，没有捷近，扎实的学习是唯一的捷近。 一篇RNA-seq分析流程的综述，全面而详细！深度好文...[作者空间]
3大数据库超2万RNA-seq数据重新统一处理 各种大型计划产出的RNA-seq数据资源已经非常丰富了，但是大家都...[作者空间]
续上回WGCNA的代码实战https://www.jianshu.com/p/9a03a35cabf3，这回把WG...[作者空间]
htseq-count计数的相关内容前面在不同的学习阶段写过两次，分别是合并htseq-count的结果得到cou...[作者空间]
参考自生信技能树：https://github.com/shenmengyuan/RNA_seq_Biotrain...[作者空间]
以Illumina测序仪说明二代测序的一般流程: （1）文库制备 将DNA用雾化或超声波随机片段化成几百碱基或更短...[作者空间]
刘小泽写于19.2.21或许这还是个比较常用的需求 我们做转录组分析，得到的结果可能是FPKM。但是FPKM确实存...[作者空间]
随着测序成本的不断下降，转录组测序分析已然成为生物学及医学研究不可或缺的技术手段。 但是，对于大多数初学者来说，会...[作者空间]
刘小泽写于19.2.9转录本定量一般有两种方式，一个是基于比对定量（如RSEM、eXpress）；另一种是不基于比...[作者空间]
该脚本适用于featureCounts数counts后的cpm和tpm计算 setwd("~/Desktop")#...[作者空间]
参考文章http://www.bioinfo-scrounger.com/archives/342计算FPKM值，...[作者空间]
1. 寻找软件所在的镜像 用conda安装软件的标准语法格式为： 其中-c这个参数很重要，通过它来指定软件下载的镜...[作者空间]
