利用二代测序比三代测序碱基质量值更高的特点，对三代数据组装结果进行polish。 但是不能简单根据比对BAM文件来矫正。这里作者把 HiFI数据重新比对回基因组，计算哪些位点...[作者空间]
环状RNA（circular RNA，circRNA）是一类特殊的非编码RNA（noncoding RNA，ncRNA），也是RNA领域最新的研究热点。与传统的线性RNA（l...[作者空间]
今天我们介绍一款使用三代全长转录本数据进行转录本校正，聚类，可变剪切分析，定量和差异分析为一体的工具 - FLAIR[https://flair.readthedocs.io...[作者空间]
今天我们继续介绍一款使用三代全长转录本数据进行转录本注释和定量的工具 - Bambu[https://github.com/GoekeLab/bambu]。来自新加坡科技研究...[作者空间]
ONT全长转录组测序是指基于牛津纳米孔公司（Oxford Nanopore Technologies，ONT）三代测序平台进行的全长转录组测序。利用三代测序平台长度长 （lo...[作者空间]
我也认为长读长测序是 RNA 测序的未来！随着价格的降低和碱基质量的提升，传统的二代RNA-seq会被逐渐取代。 很多物种的转录本非常多样和复杂，绝大多数真核生物基因不符合“...[作者空间]
常见的电子注释错误问题挺多，比如UTR长度不对，缺少外显子内含子，边界有问题。没注释出来等等。这些就不做记录。此处...[作者空间]
虽然，我在 IGV 的基础上，优化增强，并开发了 IGV-GSAman，但其实我也就前几天才认认真真自己用了下，也...[作者空间]
不少朋友提了一些关于 GSAman 的建议，其中部分我们有采纳，主要原因是我自己其实基本没用 GSAman 实战过...[作者空间]
写在前面 10月份的主要工作之一是开发和完善 IGV-GSAman，我完全有信心说 GSAman 是目前人工矫正基...[作者空间]
邀请并收到一位「GSAman」用户的稿件，非常详尽且实在。相信这份推文可以为一些做功能基因组方面工作的朋友，提供实...[作者空间]
视频推荐 请先在B站观看视频，毕竟看视频比看书学习快多了 1.B站检索（第一天：illumina、PacBio、N...[作者空间]
写在前面 今天周末，转眼10月份只剩一周。万万没想到，一个月下去，我还是花了不少时间在完善「GSAman」。至于为...[作者空间]
主要功能及示例： 1）计算merged外显子 合并同一个基因的所有splice isoforms的外显子，并生成b...[作者空间]
