通过前期的分析，我们确定了感兴趣的module，但是module中又含有几十甚至上百的基因，下一步需要进一步筛选h...[作者空间]
DAVID数据库 简介 DAVID （the Database for Annotation，Visualizat...[作者空间]
刘小泽写于19.3.11Limma作为差异分析的“金标准”最初是应用在芯片数据分析中，voom的功能是为了RNA-...[作者空间]
![mRNA-seq学习（一）：[有参]基因差异表达分析和GO注释](https://img.haomeiwen.com/is14337454/197ec652768f3ca7.png)
数据来源：Cytosolic acetyl-CoA promotes histone acetylationpre...[作者空间]
功能(GO)或者通路(Pathway)富集分析时，都会涉及到 Background; 做分析时，分析工具会提供一些...[作者空间]
刘小泽写于19.2.25好久没写咯，最近一直在写毕业论文，就给自己一周的时间写完，然后开始学习新知识?期待！到时不...[作者空间]
最近读到一篇博文，介绍了学习 RNAseq 数据分析非常推荐的两篇综述和七个在线教程并发表了相关评论。本文将进行简...[作者空间]
刘小泽写于19.2.21或许这还是个比较常用的需求 我们做转录组分析，得到的结果可能是FPKM。但是FPKM确实存...[作者空间]
刘小泽写于19.2.17依然是很容易上手的小工具得到了组装的转录本，就可以根据这个去找潜在的生物学相关信息，比如编...[作者空间]
目录 标准化1.1. House-keeping gene(s)1.2. spike-in1.3. CPM1.4....[作者空间]
刘小泽写于19.2.16今天内容比较简单，易上手：看看如何作图评价定量结果 使用Trinity组装转录本，并定量后...[作者空间]
刘小泽写于19.2.15先来看一个例子 如果得到的表达矩阵如下： 发现： gene1在低抗样本中的表达量在50左右...[作者空间]
环境准备 安装软件: 参考「基因组学」使用OrthoFinder进行直系同源基因分析 安装OrthoFinder...[作者空间]
刘小泽写于19.2.13做无参真的需要比有参更多的耐心啊 假设现在对两组样本进行转录组测序，得到5个基因（每条基因...[作者空间]
刘小泽写于19.2.9转录本定量一般有两种方式，一个是基于比对定量（如RSEM、eXpress）；另一种是不基于比...[作者空间]
写在前面 硕士毕业做的大豆内参基因的筛选，当时用了geNorm, NormFinder和BestKeeper三个软...[作者空间]
单细胞及单分子在表观的应用 文献题目：Single-cell and single-molecule epigen...[作者空间]
不管芯片数据还是测序数据，得到的差异表达基因DEGs都是独立的基因，如果直接对这些基因分析叫单基因分析，这种分析会...[作者空间]
基因组共线性工具MCScanX使用说明 简介 MCScanX工具集对MCScan算法进行了调整，用于检测共线性和同...[作者空间]
