前言 受启发于一篇文献Parent-independent genotyping for constructing...[作者空间]
学位论文整得七七八八了。回首过去三四年,感觉“在技术上”落后的“大体同时”接触生信的朋友们。或者这就是人生,或许得...[作者空间]
原文链接: 数据标准化方法:该如何选择? 什么是数据标准化? 在微生物组学数据分析之前,我们常常需要根据数据量纲的...[作者空间]
在今年的 6 月份,基因组学领域的权威期刊Genome Biology发表了一篇方法学评估类文章,在这篇文章中作者...[作者空间]
原创:hxj7 关键词:phred; trim; mott; NGS(二代测序)分析的起点往往是fastq文件。f...[作者空间]
之前的笔记:聚类介绍:点这里层次聚类分析案例(一)层次聚类分析案例(二) 案例三:基因聚类 获取全基因组表达数据的...[作者空间]
之前的笔记:聚类介绍:点这里层次聚类分析案例(一) 案例二:亚马逊雨林烧毁情况 1999~2010年,33000平...[作者空间]
关于聚类分析的介绍,可参见本人之前的笔记:聚类分析 案例一:世界银行样本数据集 创建世界银行的一个主要目标是对抗和...[作者空间]
(一)什么是聚类 聚类,将相似的事物聚集在一起,将不相似的事物划分到不同的类别的过程。是将复杂数据简化为少数类别的...[作者空间]
目录 1.KNN简介2.KNN算法步骤3.决策边界4.K的选择5.要注意的问题6.小结 1.KNN简介 KNN(K...[作者空间]
1. 遗传算法简介 遗传算法(Genetic Algorithms,GA)是一种模拟自然中生物的遗传、进化以适应环...[作者空间]
5.参数实验 上一节中,我们看到小鸟们聚集到一个较小的范围内后,不会再继续集中。这是怎么回事呢?猜测:1.与最大速...[作者空间]
3.粒子群算法模型 介绍完了粒子群算法的流程,再来详细介绍一下粒子群算法的模型。鸟群有三个决定其搜索结果的参数C1...[作者空间]
1. 粒子群算法简介 粒子群算法(Particle Swarm Optimization,PSO)是一种模仿鸟群、...[作者空间]
1. 优化算法的分类 (以下描述,均不是学术用语,仅供大家快乐的阅读) 1.1常见的优化算法 在分类之前,我们先列...[作者空间]
(一)优化算法的介绍 (以下描述,均不是学术用语,仅供大家快乐的阅读) 1.1(what)什么是优化算法? ...[作者空间]
算法复杂度分为时间复杂度和空间复杂度。时间复杂度是指执行算法所需要的计算工作量,而空间复杂度是指执行这个算法所需要...[作者空间]
首先看斐波那契数列的问题 首先我们来看最简单的斐波那契数列的问题: 拿到这个问题,直观上非常简单,几乎是一个递归就...[作者空间]
打点法: 是最简单的比较两个序列的办法,理论上可以用纸笔完成。 如果要比较这两个序列 还可以用一条序列自己对自己打...[作者空间]
1.等价矩阵: 与DNA等价矩阵的道理相同,相同氨基酸之间的匹配得分为1,不同氨基酸间的替换得分为0。在实际的序列...[作者空间]