微生物(microorganism, 简称microbe)是一些肉眼看不见的微小生物的总称。作为地球上最古老的生物...[作者空间]
MGCA Microbial genome component and annotation pipeline I...[作者空间]
CAZy数据库简介 CAZy 全称为Carbohydrate-Active enZYmes Database,碳水...[作者空间]
PGCGAP 是用于原核生物基因组学和比较基因组学分析管道,目前该管道包含 12 个模块,可以接受 Illumin...[作者空间]
使用场景 假设有一个 fasta 格式的序列文件SRR9620252.faa,我们想要提取其中的一些序列到一个新的...[作者空间]
(1)是什么?含义是什么? ,全称为fixation index,是一种用于衡量群体间分化程度的统计检验量(由Wr...[作者空间]
写在前面 早前我在 TBtools 中基于NG86逻辑实现 Ka/Ks 计算时走了不少弯路,其中种种,或许只有 C...[作者空间]
1. MUMmer简介 MUMmer(Maximal Unique Match mer)软件中使用率最高的命令nu...[作者空间]
分子钟:一个特定的生物大分子(蛋白质或DNA)在所有的演化谱系中具有恒定的演化速率。其中,演化谱系是指不同类群。B...[作者空间]
最近看了几篇关于共线性分析的微信/简书推送,发现不少研究人员把“编码基因共线性”错误地描述为“全基因组共线性”。这...[作者空间]
文献信息 标题:Comprehensive prediction of secondary metabolite ...[作者空间]
1.需求 如图,热图自带聚类树,将样本(列)分成了三个簇。想要按照聚类的结果,获取到 的信息,并将这个信息添加到热...[作者空间]
原标题:未培养原核病毒基因组通过基因共享网络进行物种分类 Taxonomic assignment of uncu...[作者空间]
导读 学习宏病毒组。 分析工具特点发表杂志发表时间被引量VirSorter组装,PERLPeerJ2015363V...[作者空间]
北外源 conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu....[作者空间]
前言:Nanopore的超读长测序能在短时间内产生海量数据,借助官方分析软件Epi2Me,可以直接进行数据分析。但...[作者空间]
作者:charon审稿:童蒙编辑:angelica 引言 在做基因或者蛋白质功能注释的时候,NR数据库包含非常重要...[作者空间]
导读 基因岛(Genomics Islands,GIs)是一些细菌、噬菌体或质粒中通过基因水平转移整合到微生物基因...[作者空间]
一、数据准备 首先,选取不同物种的Protein数据集:Arabidopsis_thaliana.fa;Citru...[作者空间]
宏基因组 ( Metagenome)是1998年提出的概念,也称微生物环境基因组(Microbial Enviro...[作者空间]