Hi-C技术通过交联等实验步骤获得空间上相连的DNA片段,即物理位置上较远的DNA片段之间的互作信息。根据染色体内...[作者空间]
snpEff4.0软件之后默认下载安装所有动物的库(ensembl的库) 但是ensembl的库有个缺点就是注释出...[作者空间]
基因组发生重排而导致的,一般指长度1 kb 以上的基因组片段的拷贝数增加或者减少, 主要表现为亚显微水平的重复或者...[作者空间]
基因流(也称基因迁移)是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质,从而改变群体“基因库”的组成。通过基因...[作者空间]
论文 GENESPACE: syntenic pan-genome annotations for eukaryo...[作者空间]
基因组学的定义: 基因组学的目的是对一个生物体所有基因进行集体表征和量化,并研究它们之间的相互关系及对生物体的影响...[作者空间]
比较基因组学中,共线性的分析的图无疑是很漂亮的。 共线性分析可以很好地解释进化关系和多倍化事件。上一篇介绍了怎么利...[作者空间]
最近文章要求原始数据上传NCBI数据库,小白摸索了一路总算有了点认识哈哈~写下来当做笔记。 1.账号 首先我们要登...[作者空间]
BUSCO是Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs(通用单拷贝同...[作者空间]
https://bioconductor.org/packages/devel/bioc/vignettes/gg...[作者空间]
tructure是与PCA、进化树相似的方法,就是利用分子标记的基因型信息对一组样本进行分类,分子标记可以是SNP...[作者空间]
参考:https://www.jianshu.com/p/0a14d971bd0a[https://www.jia...[作者空间]
GenomeView是什么? GenomeView通过Python直接展示基因组数据。主要的特点包括: 易扩展 可...[作者空间]
最近需要画LD block,之前一直用haploview软件画,haploview软件毛病比较多,比如不能有多态位...[作者空间]
我只是个搬运工,侵权请私信,速删 方法一:blast 数据准备:下载NCBI 中相关蛋白序列,将所有的fa序列放在...[作者空间]
基础概念 Phasing,基因定相/基因分型/单倍体分型:将二倍体or多倍体基因组上的等位基因,按照其亲本正确定位...[作者空间]
一、InterPro数据库简介 Interpro是集成了蛋白质家族、结构域和功能位点的非冗余蛋白质特征序列数据库。...[作者空间]
大家好!我是Honglei,欢迎大家来到基因组学专栏! 今天我们将对基因组学进行介绍。 什么是基因组学? 基因组学...[作者空间]
整理了一些目前知道的与组学相关的工具,可能不全面,欢迎补充 基因组学 一代组装 Celera Assembler:...[作者空间]
在基因组注释上,MAKER算是一个很强大的分析流程。能够识别重复序列,将EST和蛋白序列比对到基因组,进行从头预测...[作者空间]