前言,今天刚好在群里看到有人问“请问10X一个样本测多少个G比较好”,群主给出了答复,但是我对300这个数怎么来的...[作者空间]
轨迹推断,顾名思义是推断细胞分化状态的一种方法,然而现行的轨迹推断的方法都不能将周期纳入其中,但是总会有人这样想,...[作者空间]
前言 作为表观基因组的工具,MACS2是call peaks强而有力的工具,那么MACS call peak的基本...[作者空间]
在特定的细胞或组织中,发挥作用的转录因子在调控网络中的地位也是不同的。来自胚胎干细胞和其他细胞模型的研究表明,一小...[作者空间]
转录调控网络(TRN)的重建是人类遗传学中的长期挑战。已经开发出许多计算方法来从高通量数据推断人类转录因子(TF)...[作者空间]
翻译自:http://www.sthda.com/english/wiki/cox-proportional-ha...[作者空间]
miRNA是重要的转录后基因表达调控因子,并在各种生物学过程中发挥关键作用。据报道,miRNA的异常调控与多种疾病...[作者空间]
翻译自:http://www.sthda.com/english/wiki/survival-analysis-b...[作者空间]
前不久小编接触了这样一个分析,给定基因表达矩阵后,通过自组织映射(Self-organizing map,SOM)...[作者空间]
前情回顾:单细胞时代 || 细胞身份概念的演变[https://www.jianshu.com/p/c563131...[作者空间]
原文链接Chapter 10 Clustering[https://osca.bioconductor.org/c...[作者空间]
网络图 在传统的网络图里面,一般分为非权重网络和权重网络对于非权重网络: 非权重网络的特点是只能表示两个点之间是否...[作者空间]
HPA数据库全称The human protein atlas,即人类蛋白图谱,里面有关于蛋白研究的许多信息,如蛋...[作者空间]
一、简介 limma应用于RNA-seq数据时,read counts被转换为log2-counts-per-mi...[作者空间]
一、什么是批次效应 批次效应(batch effect),表示样品在不同批次中处理和测量产生的与试验期间记录的任何...[作者空间]
介绍 恶性实体瘤组织不仅包括肿瘤细胞,还包括与肿瘤相关的正常上皮和基质细胞,免疫细胞和血管细胞。基质细胞被认为在肿...[作者空间]
应用单细胞测序技术研究科学问题越来越普遍,当下应用最火热的是10X Genomics公司的解决方案,但是在某些特殊...[作者空间]
在NGS分析入门阶段,我们不需要考虑太多的细节,只用知道一个分析的大致流程并完整跑下来即可。太多的细节,只会让我们...[作者空间]
Basic Statistics 基本信息 Encoding: 测序平台编号,现在Sanger/ Illumin...[作者空间]
目录 [TOC] 本系列是有关LaTeX的学习系列,共计19篇,本章节是第19篇。前一篇:18LaTeX学习系列之...[作者空间]