前两期中我们做了一些前期的铺垫和介绍，提到（加链接），这一期我们实践操作，使用ChAMP软件包分析甲基化芯片数据，...[作者空间]
经过预处理之后的数据，就可以进行差异分析了。对于甲基化芯片而言，有两个方面的差异分析 DMP 差异甲基化探针 DM...[作者空间]
对于甲基化芯片的差异分析，除了有探针水平的差异分析，还有差异甲基化区域DMR分析。 差异甲基化区域的示意图如下： ...[作者空间]
当我们得到差异的探针或者差异的甲基化区域之后，通常都会分析这些差异区域对应的基因是否在特定功能上有富集。在ChAM...[作者空间]
DNA甲基化会调控基因的表达水平，进而影响基因的相互作用。将基因的相互作用网络和差异甲基化信息结合起来，基于那些甲...[作者空间]
分析DNA甲基化的手段有很多，除了甲基化芯片外，还有WGBS和RRBS等实验与高通量测序相结合的手段，不管是哪种策...[作者空间]
bismark 软件根据序列的比对情况就可以识别甲基化位点，首先需要对基因组建立索引，建好索引之后，就可以开始比对...[作者空间]
在bismark中，根据甲基化的C所处的上下文环境，分成以下3类； CpG CHG CHH p代表磷酸二酯键，Cp...[作者空间]
methylKit 是一个用于分析甲基化测序数据的R包，不仅支持WGBS，RRBS和目的区域甲基化测序，还支持ox...[作者空间]
DNA甲基化作为表观遗传的一种标记，在生长发育和疾病发生过程中扮演着重要角色。随着大规模甲基化研究的进行，积累了大...[作者空间]
在DNA甲基化与疾病的研究中，最常见的一个问题就是，是否有已经发表的文献表明某个基因在某种疾病中发生了甲基化。回答...[作者空间]
在NGS飞速发展的时代，有大量研究通过GSWA的方法，阐述了SNP于疾病之间的关联; 也有学者利用WGBS，RRB...[作者空间]
在MethHC数据库中，提供了18种癌症相关的DNA甲基化，microRNA表达谱和基因表达谱的数据，这里的数据来...[作者空间]
癌症作为人类健康的头号杀手，引起了科研工作者的官方关注。鉴于DNA甲基化修饰在肿瘤中的重要作用， MethyCan...[作者空间]
