很长一段时间里发现一个问题，在平常的实验过程中，有一些童鞋还是会对生物学重复和技术重复有一些混淆，今天我们彻底再重...[作者空间]
写在前面 其实很多作者已经探索的差不多了，相关脚本、教程也很多，但我还是自己系统的总结一下吧。有时候感觉是浪费时间...[作者空间]
整理ChIP-seq / CUT & Tag 分析时用到的工具。本文只对使用的工具用法进行简单介绍。 deepto...[作者空间]
因为我上面的样本是CK和treatment的，所以需要发现2个样本之间的差异peak。 对于差异的peak我依旧用...[作者空间]
一、介绍 ChIP-seq，测序方法ChIP 指染色质免疫共沉淀技术（Chromatin Immunoprecip...[作者空间]
homer软件来寻找motif 下载数据库 运行homer软件 homer软件找motif整合了两个方法，包括依赖...[作者空间]
ChIP-seq数据分析实战训练（三） 六、合并bam文件 在进行peaks calling的时候，需要把bam...[作者空间]
一、不求甚解系列 软件下载及配置 conda安装： conda install -c bioconda homer...[作者空间]
刘小泽写于2020.4.2之前写了：了解ChIP-seq的实验流程继续了解ChIP-seq上一篇是：关于ChIP-...[作者空间]
1. 介绍 Bowtie2 是将测序reads与长参考序列比对工具 (适用于将长度大约为50到100或1000字符...[作者空间]
说到deeptools，[https://www.baidu.com/link?url=6F9PeldteljlC...[作者空间]
具体流程见trim_galore去接头(并行处理)命令为 config是需要进行处理的文件列表trim_galor...[作者空间]
玩转gtf 查看gtf每一行的信息 发现第九行是基因ID 第九行后用';'分隔后的第一行是gene_idimage...[作者空间]
TF: transcription factor转录因子TFBS: transcription factor bi...[作者空间]
外显子和内含子是转录本上面的概念，是基于转录这个行为的定义。 而5端UTR区域和CDS区域，还有3端UTR区域,是...[作者空间]
