学习目标 了解 DESeq2 涉及的不同步骤 了解变异的来源并检查 size factors 检查基因水平的离散估...[作者空间]
简介 在单细胞数据分析过程中,我们经常会遇到不同样本之间整合的批次效应和细胞类型注释的困难,projectLSI包...[作者空间]
MultiQC aggregates results from bioinformatics analyses a...[作者空间]
RNA缩略词详解 lncRNA:长链非编码RNA(long non-coding RNA) miRNA:微小RNA...[作者空间]
很久没有跟新啦~~~忙着基金。。基金。。还是基金,然后就是文章。。文章。。还是文章。终于有空整理之前的东西。 说绘...[作者空间]
随着现在研究的不断深入,越来越多的情况需要我们对多种数据的联合分析,其中在单细胞没有出来之前,普通转录组(bulk...[作者空间]
HISAT2,StringTie,Ballgown处理转录组数据思路如下: 数据质控 将RNA-seq的测序rea...[作者空间]
在之前学习snakemake的基础上,这里重新又对之前编写的pipline进行了优化,只需要在config.yam...[作者空间]
看这个之前先看下批量对多个测序文件进行fastqc 1 把所有文件进行fastqc,得到QC结果,然后用multi...[作者空间]
文献信息 标题:Global identification of Arabidopsis lncRNAs reve...[作者空间]
hisat2+stringtie for ((i=2064449;i<2064457;i++)); do hisa...[作者空间]