如果你正在尝试访问Chatgpt网站，但由于某些原因无法访问该网站，那么你可以尝试使用Chatgpt的国内镜像网站...[作者空间]
全基因组关联分析（Genome-wide association study，GWAS）是应用基因组中数以百万级别...[作者空间]
四、Shell脚本 [TOC] 编写自定义脚本的时候，可以在用户的家目录下的创建一个 bin 目录，然后将自定义脚...[作者空间]
网络图 共现网络是研究突出了不同环境下微生物群落间的相互作用模式重要方式，可以从网络角度理解微生物群落共现特征，包...[作者空间]
什么是read? 高通量测序时,在芯片上的每个反应,会读出一条序列,是比较短的,叫read,它们是读序；就是我们测...[作者空间]
1.创建PBS脚本 #如何在linux下创建一个可运行shell脚本 #新建一个.sh文件 touch cellr...[作者空间]
CheckM 提供了一套用于评估从分离株、单细胞或宏基因组中获得的基因组质量的工具。它通过使用在系统发育谱系中普遍...[作者空间]
日常瞎掰 RNA-seq最常用来研究两种condition下有哪些基因的表达值发生了改变，即差异表达基因(di...[作者空间]
【原创】在NCBI查找指定物种基因组信息 生信分析中经常需要查找指定物种的基因组信息。如：基因组相关分析中需要借助...[作者空间]
关于宏基因组测序： 直接对提取的全宏基因组DNA建立随机小片段文库，能够获取更多的序列信息。通过组装、ORFs预测...[作者空间]
遇到了一个16S的课题，于是开始认真学习ASV和OTU的差别，顺手整理一下。 扩增子测序和鸟枪法测序已经成为微生物...[作者空间]
判别分析（DA）是一种根据观察或测量到的若干变量值，来判断研究对象如何分类的常用统计分析方法。偏最小二乘回归（Pl...[作者空间]
PerMANOVA分析(也叫NPMANOVA、Adonis分析)是一种以距离矩阵为对象的多元方差分析。以图1的PC...[作者空间]
简介 该宏基因组流程主要有四步，分别是1.检查raw data；2.获得高质量reads；3.合并PE数据；4. ...[作者空间]
cd-hit是用于蛋白质序列或核酸序列聚类的工具，根据序列的相似度对序列进行聚类以去除冗余的序列，一般用于构建非冗...[作者空间]
参数检验和非参数检验的区别： 定义不同：参数检验：假定数据服从某分布（一般为正态分布），通过样本参数的估计量（x±...[作者空间]
根据已有的蛋白库，对从基因组上提取到的蛋白序列进行比对，从而获得相应的信息。 常用的数据库： Nr：NCBI官方非...[作者空间]
经常会遇到已经有KO-number(代表基因家族信息)在各样品中的丰度，如何转换为level3等级的KEGG pa...[作者空间]
1、mapping（bowtie2）比对，估计基因丰度 2、利用contig的核酸组成和丰度的算法来binning...[作者空间]
