Tn5转座酶结构 Tn5转座子由编码三个抗性基因的核心序列（kan、ble、str）和两条倒置的IS50序列组成，...[作者空间]
1. 切割位点 ATACseq 应该在较小的保护区（如转录因子结合位点）周围生成较短的片段（我们的无核小体区域）。...[作者空间]
在下部分中，我们将研究如何使用 R/Bioconductor 识别开放区域中的变化。 在这里，我们将采用类似于 D...[作者空间]
1. 注释开放区域 将已识别的无核小体区域与基因组特征（如基因和增强子）相关联通常很有趣。 一旦注释到基因或增强子...[作者空间]
1. 质控 ATACseqQC 库允许我们在一个步骤中运行我们已经看到的许多 ATACseq QC 步骤。它可能会...[作者空间]
1. 子集划分 我们可能希望将比对的读数分成代表核小体游离和核小体占据的读数。在这里，我们通过使用插入大小来过滤读...[作者空间]
1. 结果处理 现在我们已经处理了 Greenleaf ATACseq 双端数据，我们可以开始处理比对。 首先，我...[作者空间]
1. 简介 ATACseq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin...[作者空间]
简介 本课程[https://rockefelleruniversity.github.io/RU_ATACseq...[作者空间]
ATAC-seq全称Assay for Transposase Accessible Chromatin with...[作者空间]
最近遇到一个问题，用DiffBind找差异peaks，但是网上没有找到合适（直接用）的参考，网上的例子[https...[作者空间]
本文分享我的 ATAC-Seq 分析流程，为了控制篇幅，关键的 Peak calling 步骤会详细介绍，而 Mo...[作者空间]
关于ATAC-seq分析，在网上看到两篇关于同一片综述的翻译，写的很好：ATAC-seq数据分析工具的比较和推荐（...[作者空间]
1. 学习目标 讨论ChIP-seq数据质量评估的其他方法 用ChIPQC产生质量统计报告 鉴定低质量数据的来源概...[作者空间]
