前一篇推送解读了2022年发表在DC上的关于拟南芥再生的文章。文章种利用TOBIAS鉴定了转录因子的活性。本次推送...[作者空间]
DecontX是一种通过去除RNA测序数据中非细胞信号的工具，它适用于单细胞RNA测序数据和高通量RNA测序数据。...[作者空间]
Azimuth 是Seurat那个组出的注释工具。 有网页版，有R包。 Azimuth annotation • ...[作者空间]
做完通路富集分析，拿到几十条富集通路后，我们经常会寻找与“某关键词”相关的通路。例如与癌症相关的通路，与免疫相关的...[作者空间]
本节来复现nature microbiology上的一张带聚类的条形图，图均基于ggplot2,ggtree，通过...[作者空间]
抗体工程技术在药物开发中具有越来越重要的意义，并且已经开发了不同的生物治疗剂，包括利用抗体片段，双特异性抗体或抗体...[作者空间]
高通量功能基因组学的分析每次能得到成百上千的基因和大量的通路，要在这大量的基因和通路里分析出生物学意义上更重要的部...[作者空间]
决策树对于事物的分类特别有用，能够对新出现的事物给出正确的分类，比如生死，如何进行治疗等。比起文本描述的规则， 图...[作者空间]
转录调控网络（TRN）的重建是人类遗传学中的长期挑战。已经开发出许多计算方法来从高通量数据推断人类转录因子（TF）...[作者空间]
今天的主要内容是实现下面这幅图 做完聚类分析通常可以选择树形图来展示聚类分析的结果，之前公众号也分享过一篇文章 。...[作者空间]
GSEA简介 基因集富集分析（GSEA）是一种计算方法，可确定先验定义的基因集是否在统计上显示两种生物学状态之间存...[作者空间]
![[R]bioconductor之GenomicFeatures学](https://img.haomeiwen.com/is20354525/1c32cab598e64cd2.png)
GenomicFeatures包主要提供了TxDb对象结构。基于此对象的操作，we can easily down...[作者空间]
ggstatsplot(https://indrajeetpatil.github.io/ggstatsplot/...[作者空间]
论文题目 Kablammo: an interactive, web-based BLAST results vi...[作者空间]
Tips： 这一篇文章，类似单细胞RNA-seq 最佳实践教程，对每一步进行了具体介绍讨论。目前技术和分析方法都出...[作者空间]
转自：http://www.360doc.com/content/18/0208/11/19913717_7285...[作者空间]
之前的文章里已经按照教程进行了TCGA数据库的一些练习（RNA-seq、芯片、生存分析），现在学习TCGA甲基化数...[作者空间]
蛋白结构分析在线软件集锦 序列相关 密码子表达优化：Jcat 核酸翻译为蛋白：Translate 序列比对和搜索：...[作者空间]
安装 docker镜像安装 镜像使用方法 普通安装 在Mac OS X上使用Homebrew或者在Linux系统上...[作者空间]
