概念 (1)GWAS: 全称“全基因组关联分析”,使用统计模型找到与性状关联的位点,用于分子标记选择(MAS)或者...[作者空间]
在获得SNP和INDEL后,需要对raw data进行质控,剔除假阳性的标记,GATK官方推荐的方法是VQSR,原...[作者空间]
今日分析遇到的问题GWAS结果合并很多SNP,想在注释文件中提取某些SNP的注释信息,本来想用R分析,奈何小麦的注...[作者空间]
GWAS分析基本流程及分析思路[https://www.cnblogs.com/chenwenyan/p/1012...[作者空间]
本文旨记录免费的系统的生信学习教程,如有侵权,可私信删除。生信技能树的论坛、博客、公众号可真是个大宝藏呀,值得生信...[作者空间]
y一、认识文件名 五大格式文件:ped&mapbed&fam&bim 各自存储何种数据 五种格式 ①ped(ped...[作者空间]
一、 查看某一个snp的基因型频率 如果要计算全部snp频率则去掉“--snp rs10402893”命令就好 二...[作者空间]
前言 生物信息分析人员一般会接触到从NCBI等网站下载的SRA数据,之前也介绍了下载SRA数据的几种方式。下面,我...[作者空间]
重测序技术简介 全基因组重测序(Resequencing)是对已知参考基因组序列的物种进行不同个体间的基因组测序,...[作者空间]
三、多聚酶链式反应扩增DNA片段 1.PCR:多聚酶链式反应的简称,是一种体外迅速扩增DNA片段的技术,它能以极少...[作者空间]