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awk 'FNR==NR{a[$1];next}($1 in a){print}' spikelet_GWAS_snp.txt 4.end.exonic_variant_function.txt > sort.exonic.get_annotation_snp.txt
今日分析遇到的问题
GWAS结果合并很多SNP，想在注释文件中提取某些SNP的注释信息，本来想用R分析，奈何小麦的注释文件最后达到12G，会卡爆我的电脑。就搜索，出来grep 的用法，我的正则表达式用的并不熟练。 想到之前用的awk用法，直接搜awk 提取index ；
总共看了三个教程
👢[linux]根据一串ID批量提取另外一个文件的指定行 - 简书 (jianshu.com)
awk处理两个文件示例 - 简书 (jianshu.com)
(15条消息) Shell awk两个文件的对比 NR和FRN_weixin_34195546的博客-CSDN博客
第一个有些代码自己看不懂
直接用的第二个代码
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今日分析遇到的问题GWAS结果合并很多SNP，想在注释文件中提取某些SNP的注释信息，本来想用R分析，奈何小麦的注...
从sql中提取某一列。 方法：awk:awk -F ',' '{print $1}' aaa>aa sed 's...
cut 命令 grep 在文件中提取行，cut awk sed 提取列 cut [选项] 文件名 -f 提取第几列...
从gff3提取intron的坐标信息： # 提取mRNA和exon信息： awk '{if ($3 == "mRN...
awk复习心得 目前只会提取符合要求的列 默认分隔符是空格 awk {’print $1‘} test.txt 提...
移动目录下所有文件 批量重命名 awk筛选提取大文件
#提取指定hash类型的键值对 redis-cli HGETALL /php/test/abc|awk -F'"'...
[TOC] 简介 我们常在命令行中使用awk命令提取转换文件文本内容，可以说，awk是命令行中文本处理的瑞士军刀，...
若是需要提取一个字符串中想要的数据，可以思考下awk
1. 问题引入 现阶段提取文本记录或字段时，用awk比较多，同时也多和grep, 管道等一起使用。比如，我要提取c...
本文标题：awk 提取
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/nnyvkrtx.html
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