使用工具 fastp(质控), hisat2(比对), samtools(sam文件转bam文件), featur...[作者空间]
简介 SyRI,全称Synteny and Rearrangement Identifier,是一个使用 whol...[作者空间]
安装 使用[作者空间]
实验设计:对照组,TNF处理组,TGF处理组,IL4处理组,每组3个生物学重复实验分组:TNF组 vs 对照组;T...[作者空间]
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在之前的学习和练习里,比对这一步我使用过bowtie2(DNA比对)和hisat2(RNA-seq比对),现在学习...[作者空间]
目的 一个新的物种(没有参考基因组)用Trinity从头组装得到的转录本fasta文件,需要将其转换成gtf文件 ...[作者空间]
本文转载于百迈克云(https://www.sohu.com/a/234594093_761120) 在群体遗传学...[作者空间]
经典的转录组差异分析通常会使用到三个工具limma/voom, edgeR和DESeq2。今天我们就通过一个小规模...[作者空间]
文章摘自:https://www.jianshu.com/p/d9d76ce23822https://www.ji...[作者空间]
1、打开下载目录 cd /bigdata/wangxj/Gobi_16s/raw 2、下载 nohup wget ...[作者空间]
图来自: 需要注意的是DNA双链,只是部分区段是正义链,部分是反义链。换另一个区段可能完全相反。 以下部分内容是搬...[作者空间]
将染色体从contig/scaffold水平提升到chromosome水平是组装的最终目标。我们通常使用遗传图谱,...[作者空间]
【RSS】RNA-seq step by step这个RSS专题将step by step 记录我学习RNA-se...[作者空间]
参考: 从零开始完整学习全基因组测序数据分析:第2节 FASTA和FASTQ作者:碱基矿工 前言 在生物信息分析过...[作者空间]
转录组是一类让人既爱又恨的项目,实验门槛低,却是文章泛滥的重灾区,总有人问小编,现在转录组还能发文章吗?下面小编就...[作者空间]
基因组组装相关软件 abyss、ALLpath、Canu、dbg2olc、ECTools、falcon、HGAP、...[作者空间]
WGCNA分析过程中,你可以得到edge和node的文件,里面有你某一个module里所有基因相互之间的conne...[作者空间]
mhw Blibilizhn-blogmhw-zh Hello 大家好! 我们又见面了! 最近总搞FastQC报告...[作者空间]