前言 作者开发Scissor的目的是结合bulk-seq的数据,寻找与某一性状显著相关的单细胞亚群,然后从表型的角...[作者空间]
做个生物实验也是够苦逼的啊,不止结果要好看光鲜,还要做定量…… 也是醉了。明明 western blot 结果做的...[作者空间]
(1). 单细胞上游软件cellranger:单细胞上游软件cellranger从头说[https://www.j...[作者空间]
肿瘤不是单纯的恶性细胞群,而是由不同类型细胞组成的复杂生态系统。在这些细胞中,肿瘤浸润免疫细胞在肿瘤控制和治疗反应...[作者空间]
肿瘤微环境是近年来的研究热点。复杂而动态的微环境中,肿瘤细胞与浸润性免疫细胞、基质细胞等相互作用,这在促进或抑制肿...[作者空间]
前言 干细胞(stem cells, SC)是人体内具有自我复制和多向分化潜能的原始细胞,而这种自我更新和分化为成...[作者空间]
2018年的Nature 上公开了一份尿路上皮癌(BLCA)的免疫治疗队列数据,而这份数据就储存在IMvigor2...[作者空间]
1. Kaplan-Meier生存分析 Kaplan Meier是一种单因素生存分析,它可用于研究1个因素对于生存...[作者空间]
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2021/03/15这里有一些数据库的介绍,极其简单一、High-throughput sequencing da...[作者空间]
单细胞空间转录组和单细胞分析类似,不可避免的会遇到多样本的问题,这就需要使用多样本整合分析策略Seurat提供了多...[作者空间]
将空间位置信息和转录组分析相结合,对于癌症、免疫、肿瘤免疫相互作用,组织微环境,神经和发育等领域,有着令人期待的应...[作者空间]
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追热点,好吗?当然好,只要有足够的基金,热点还是比较容易发大文章的,但是需要注意,测序前还是应该有合理,目的明确的...[作者空间]
仅在过去的两年时间,基于bulk RNA数据反卷积进行不同细胞/组织比例的预测软件开发就很多,谷歌以 deconv...[作者空间]
单细胞技术在 2013 年和 2019 年被 Nature Methods 评选为年度技术,2018 年被 Sci...[作者空间]
之前在Connectivity Map(cMap)的探索应用(二)中提到了两种cmap在线分析网站,一个是buil...[作者空间]
之前Connectivity Map(cMap)的探索应用(一)和Connectivity Map(cMap)的探...[作者空间]
上篇Connectivity Map(cMap)的探索应用(一)中简单提及以下两种做法:一是提供了cMAP的在线分...[作者空间]
Inferring tumour purity and stromal and immune cell admix...[作者空间]