一、cnvkit 安装 官网：https://cnvkit.readthedocs.io/en/latest/[h...[作者空间]
写在前面的话 今天是2021年1月3号，年底一番瞎忙活，停更了好长一段时间的简书。人生中有个很重要伯乐导师告诉我，...[作者空间]
1. 通过varscan2探测somatic和germline的突变 对于有normal-tumor的配对样本，v...[作者空间]
1. 什么是VCFCVF是用于描述SNP，INDEL和SV结果的文本文件。做过DNA重测序，群体遗传进化，BSA，...[作者空间]
不同的结构变异（structural variation，SV）鉴定工具鉴定出的VCF结果文件格式不尽相同，但也不...[作者空间]
关于为何要进行SNP的过滤： 第一，低质量和无信息的SNP会影响后续群体结构或GWAS的分析结果，甚至影响后续对生...[作者空间]
整理了一些目前知道的与组学相关的工具，可能不全面，欢迎补充 基因组学 一代组装 Celera Assembler:...[作者空间]
本文转载自 ： http://www.bioinfo-scrounger.com/archives/254 Fr...[作者空间]
1.SPAdes的使用目的 当前版本的SPAdes与Illumina或IonTorrent读取一起使用，并且能够使...[作者空间]
GATK现在最新的稳定版已经到了3.8，测试版是4.0。3.8版和之前的版本还是有比较大的不同的，但核心算法与...[作者空间]
