前言 对跨物种的RNA-seq进行标准化和差异分析已知是一个问题,而目前对此类问题的相关研究还比较少,有用RPKM...[作者空间]
VCF文件的变异分布图,除了使用Circos图之外,统计特定材料间的变异分布情况时可能会用到染色体分布图,为了节省...[作者空间]
OrthoMCL介绍 1. OrthoMCL的用途 基于序列的相似性,OrthoMCL能将一组proteins(比...[作者空间]
系统进化树学习笔记。 系统进化树简介 系统进化树(Phylogenetic tree):用一种类似树状分支图形来概...[作者空间]
前言 植物基因组大小跨越几个数量级,倍性和杂合性变化,以及新旧基因组转座子变化等带来组装挑战。三代和物理图谱提供了...[作者空间]
个人进行SNP分析用的软件是snippy[https://github.com/tseemann/snippy],...[作者空间]
泛基因组是对某一物种全部基因组序列的总称,目的在于获取该物种完整的遗传信息,以解决单个参考基因组给群体研究带来的许...[作者空间]
Zoonomia project: 120余个未曾报道的哺乳类基因组数据集原标题: A comparative g...[作者空间]
1. synteny 和 collinearity 用来描述基因组的共线性 synteny 共线性:同源基因在相应...[作者空间]
https://github.com/mmatschiner/tutorials 在github上看到一个关于ph...[作者空间]
OrthoFinder结果文件 运行标准OrthoFinder会产生一系列文件:直系同源组、直系同源、基因树、物种...[作者空间]