前言 很多人问我有没有关于全基因组关联分析(GWAS)原理的书籍或者文章推荐。 其实我个人觉得,做这个分析,先从跑...[作者空间]
NG. 玉米. Genome assembly of a tropical maize inbred line p...[作者空间]
R语言meta分析(1)meta包 R语言meta分析(2)单个率的Meta分析 R语言meta分析(3)亚组分析...[作者空间]
这篇文章是对之前啊啊救救我,为何我的QQ图那么飘(全基因组关联分析)这篇文章的一个补坑。 LD SCore除了查看...[作者空间]
在合并数据过程当中,经常会发现不同来源的数据正负链不是统一的,这是一件很头疼的事。 正负链没有统一的情况下直接合并...[作者空间]
流行病学研究常见的分析就是相关性分析了。 相关性分析某种程度上可以为我们提供一些研究思路,比如缺乏元素A与某种癌症...[作者空间]
之前我写过一篇文章群体遗传分析分层校正,该选用多少个PCA?,里面提到可以通过EIGENSTRAT软件确定显著的主...[作者空间]
前段时间有位小可爱问我,为什么她的QQ图特别飘,如果你不理解怎样算飘,请看下图: 理想的QQ图应该是这样的: 我当...[作者空间]
为什么需要做meta分析 群体分层是GWAS研究中一个比较常见的假阳性来源. 也就是说,如果数据存在群体分层,却不...[作者空间]
关于分群的软件,之前写了structure 2.3.4 软件使用指南,软件虽然有windows版本,但是操作太麻烦...[作者空间]
原文地址: SNP Filtering Tutorial 感觉文章写的真棒,于是就翻译了一遍 目标 学习如何使用V...[作者空间]
前言 关于选用多少个PCA做群体分层校正,各大期刊并没有一个统一的说法。 故做了如下综述。 1 随心所欲型,想选多...[作者空间]
一、什么是多基因风险评分 传统的GWAS研究只计算单个SNP位点与表型之间的关联性,再用Bonferroni校正,...[作者空间]
材料选择与群体设计 材料选择的基本原则 a.遗传变异和表型变异丰富 b.群体结构分化不能过于明显(如亚种以上,发生...[作者空间]
Covarrubias-Pazaran G (2016) Genome-Assisted Prediction o...[作者空间]
Nielsen R (2005) Molecular Signatures of Natural Selectio...[作者空间]
表型分析之最优无偏预测 最佳线性无偏预测(Best Linear Unbiased Prediction,简称BL...[作者空间]
去回归是一种去除方差异质性的方法,在某类数据处理时偶尔用到,比如估计基因组选择育种值时。借着文献Thistleth...[作者空间]
写在前面 很久很久以前,各种原因,我写过一个帖子,《零基础-完全重现某个基因家族分析文章(的分析部分)》 http...[作者空间]
2019年第一篇。忙碌的小半年。整理完课题,考完雅思英语终于又可以有时间去学习感兴趣的东西了。学习/记录/分享,这...[作者空间]