NTsys是一款强大的统计分析软件，具有多个统计模型组件，在植物多样性分析中经常会用到。其中最主要的模块是聚类分析...[作者空间]
本节介绍一款在线绘制基因结构的工具Gene Structure Dispaly Server（GSDS），简单好用...[作者空间]
写在前面 Emmm，有时候，我们可能通过一些比对软件，如 BLAST , DIAMON 或者 ghostz 得到一...[作者空间]
在进行共线性分析的时候需要准备两个文件：一个是blast文件，一个是gff文件。这两个文件都是需要经过相应处理的。...[作者空间]
一、序 目前对蛋白基因家族进行分析主要有两种方法，一基于同源性，二基于HMM模型。 想要通过HMM模型预测蛋白基因...[作者空间]
本文参考 生信札记[https://www.jianshu.com/u/068665394ccf] 相关内容制作 ...[作者空间]
系统发育树几乎是基因家族文章的必备图，一个好看的树图的确能给文章增色不少，一般的用户可能只使用MEGA绘图，进阶一...[作者空间]
本节我们继续来进行基因家族数据可视化的第3节教程，通过ggplot2绘制一个富有美感的基因结构图&蛋白保守结构域图...[作者空间]
隔了这么长时间终于开始更新基因家族的第2篇文档了，绘制motif分析图。以往做这类分析都是通过TBtools此款软...[作者空间]
最近有小伙伴问为怎么多快好省的发个论文顺利毕业，作为生物圈里的当事人当然推荐基因家族分析了，于是乎准备整理这一系列...[作者空间]
顺式作用元件(cis-acting element)存在于基因旁侧序列中能影响基因表达[https://baike...[作者空间]
在基因家族分析中，关于功能域可视化是一个相对比较简单的流程式方法。能够较好地了解不同物种间同一个家族结构域的保守和...[作者空间]
1.手动确认结构域； SMART：http://www.omicsclass.com/article/681[ht...[作者空间]
放一张效果图，这些，三四年前的东西，我其实一直懒得说。 写在前面 “Gene Structure View (Ad...[作者空间]
tblastn比对出来候选HSP区段，我们需要根据一定的基因长度范围来进行区域延伸去重叠，然后进行exonerat...[作者空间]
在做生信下游基因分析的时候，我们通常需要下载兴趣基因的序列信息构建进化书什么的，如果兴趣基因比较少，那么可以直接在...[作者空间]
低温是主要的严重影响植物生长和发育的环境因子，并且会影响作物的产量。植物演化出了一系列的机制，使它们能够在生理和分...[作者空间]
1. 使用CD-Search工具来可以鉴定蛋白质或者核酸序列内的保守结构域或功能单位。该工具位于NCBI中。具体我...[作者空间]
蛋白质三维结构预测，只要有目的基因的氨基酸序列就可以做，不限物种，没有太多要求，可为文章增色。windows版本的...[作者空间]
