上一步骤用IDR对重复样本peaks的一致性进行了评估,同时得到了merge后的一致性的.narrowPeak文件...[作者空间]
1.去除.narrowPeak文件首行 2.使用bedtools粗略估计两次重复的peak交集,重叠1bp就算有交...[作者空间]
1.callpeak 2.制备hg19.chrom.size文件,第3步要用:获取参考基因组chrom.sizes...[作者空间]
BAM文件是SAM的二进制转换版,bigWig是wig或bedGraph的二进制版,存放区间的坐标轴信息和相关计分...[作者空间]
1.对过滤后的fq.gz文件进行比对,并查看比对情况 2.比对后将SAM文件转为bam文件,转之前要进行排序,可以...[作者空间]
1.数据来源 2022年新发布的一篇文章,是CHIP-Seq和RNA-Seq的综合性分析文章,这里先拿CHIP-S...[作者空间]