来吧,生信搞起! 首先拿到公司给的cleandata,使用STAR进行参考基因组比对,软件安装参考其他网站给的步骤...[作者空间]
目录 1.Module 1 - Introduction to RNA sequencing Installati...[作者空间]
安装配置conda 使用清华源下载sh脚本并安装 下载完成后直接运行脚本文件bash Miniconda3-lat...[作者空间]
在之前的学习和练习里,比对这一步我使用过bowtie2(DNA比对)和hisat2(RNA-seq比对),现在学习...[作者空间]
mRNA-seq上中游分析需要用到Linux系统的terminal! 尽管TCGA数据库中已经提供了大量的处理好的...[作者空间]
参考文章:https://www.jianshu.com/p/1f5d13cc47f8https://daveta...[作者空间]
STAR下载地址https://github.com/alexdobin/STAR 下载安装: 建立索引: 20个...[作者空间]
前言 现有比对工具在做mapping之前,都需要下载对应物种的参考基因组做index,而如何选择合适的参考基因组是...[作者空间]