转自：https://blog.csdn.net/u011262253/article/details/11169...[作者空间]
写在前面 其实很多作者已经探索的差不多了，相关脚本、教程也很多，但我还是自己系统的总结一下吧。有时候感觉是浪费时间...[作者空间]
写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑...[作者空间]
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hic数据经过Hic-pro处理后，会生成allvalidpairs文件，这是所有有效配对的文件。一般想要可视化的...[作者空间]
HiC质控和fastqc有一些类似 HiCUP是一个处理由Hi-C和捕获Hi-C（Capture Hi-C，CHi...[作者空间]
Arrowhead（https://github.com/aidenlab/juicer/wiki/Arrowhe...[作者空间]
Insulation Score是由dekker实验室开发的，软件路径（https://github.com/de...[作者空间]
The Point： Background Hi‑C provides a true all‑by‑all gen...[作者空间]
一．数据标准化 1. HiCNorm http://www.people.fas.harvard.edu/~jun...[作者空间]
因为很久没用HiCPlotter，而且之前软件也进行过更新，在再次运行相关命令时，提示以下错误： ImportEr...[作者空间]
Zcat Zcat是一个命令行实用程序，用于查看压缩文件的内容，而无需对其进行解压缩。它将压缩文件扩展为标准输出，...[作者空间]
首先下载juicer后，另建一个juicer-work的文件夹，juicer-work里面各个文件夹的位置要放对，...[作者空间]
