更新什么的,都是浮云 先直接上图 其实就是x轴极化的柱状图,bar长和颜色也是连续变量,label color表示...[作者空间]
一般来说,阿里云ECS服务器的Linux系统默认是没有图形界面的,那么如何才能安装并远程连接Linux服务器上的图...[作者空间]
今天介绍一个转录因子相关的数据库KnockTF,它提供了大量将转录因子(TF)敲出/低的人类表达谱数据集,以及转录...[作者空间]
组织的细胞组分分析对于明确生物进程机制很重要,尤其是在bulk RNA-seq后,我们已经不满足于简单的肿瘤纯度的...[作者空间]
LINCS(The Library of Integrated Network-Based Cellular Si...[作者空间]
PaDEL-Descriptor是用于计算分子描述符和指纹的软件。该软件当前可计算797个描述符(663个1D,2...[作者空间]
桑基图主要用来表征数据流在不同层级不同模块之间的传播,既包含了数量级特征也包含了传播方向和模块关联属性,多层复杂网...[作者空间]
我们之前已经介绍过如何《使用xcell根据表达谱推断样本组成细胞的类型》,具体思路就是根据已知细胞系的表达谱,计算...[作者空间]
一些公司或者实验室的服务器为了安全起见,只允许允许用户在局域网内登录,离开工作地点地点就没法登陆服务器,特别不方便...[作者空间]
本文均在CentOS7(release 7.6.1810)版本下进行过的测试更多内容可以关注 Rosetta中文社...[作者空间]
liftover 是UCSC提供的一个用于不同基因组注释版本间基因组坐标转换的工具。UCSC 提供了一个web版本...[作者空间]
基因ID转换有很多方法,对高手如饮水吃饭,对新手来说却是很难逾越的高山,我推荐两个简单迅速的方法: 一 网页工具 ...[作者空间]
deepTools 是一套基于python开发的工具,适用于有效处理分析高通量测序数据,可用于ChIP-seq, ...[作者空间]
如题 自由发挥自由扩散[作者空间]
RNA-seq的数据往往需要剔除表达较低的基因,一般认为在半数以上样本中基因表达需要CPM>1,对于coding ...[作者空间]
虽然现在操作几种常用格式的专用工具都有了,比如bedtools、samtools、vcftools、bcftool...[作者空间]
说真的,这都得怪基因组... 事情起因很简单,我有个课题呢就是对40个人病人做了WES,拿到原始测序数据,...[作者空间]
打点法: 是最简单的比较两个序列的办法,理论上可以用纸笔完成。 如果要比较这两个序列 还可以用一条序列自己对自己打...[作者空间]
1.等价矩阵: 与DNA等价矩阵的道理相同,相同氨基酸之间的匹配得分为1,不同氨基酸间的替换得分为0。在实际的序列...[作者空间]
题目叫《基于网络的药物重定向机遇:基于药物导致的低血压副作用来寻找潜在抗高血压的药物》,2016年发表在Journ...[作者空间]