组织的细胞组分分析对于明确生物进程机制很重要,尤其是在bulk RNA-seq后,我们已经不满足于简单的肿瘤纯度的...
通常的空间转录组分析是基于降维聚类划分cluster,再进行cluster细胞注释。或者使用反卷积工具与单细胞转录...
概述 细胞聚类:基于基因表达信息,将表达谱相近的细胞聚为一类,表达差别大的细胞彼此分开。 Seurat使用
前言 之前我们介绍了利用scRNA不同cell cluster的表达特征,利用SVR线性反卷积的手段来估算对应的B...
仅在过去的两年时间,基于bulk RNA数据反卷积进行不同细胞/组织比例的预测软件开发就很多,谷歌以 deconv...
反卷积层和卷积层非常相似,首先需要明确反卷积层的参数是需要学习的,不是直接用反卷积层所对应的卷积层的权重,反卷积又...
我们之前已经介绍过如何《使用xcell根据表达谱推断样本组成细胞的类型》,具体思路就是根据已知细胞系的表达谱,计算...
文献名称:用于转录本空间分布预测和细胞类型反卷积的单细胞转录组和单细胞空间组学的多种整合方法的基准测试文献链接:h...
Convolution Network及其变种(反卷积、扩展卷积、因果卷积、图卷积)
基础知识 什么是细胞更新(cellular renovation)? 清除细胞旧组分,产生新组分(包括细胞器等)。...
本文标题:dtangle:基于反卷积的表达谱分解确定细胞组分
本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/xgoumctx.html
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