背景 我们经常在探索性分析中使用scRNA-seq数据来表征细胞间的异质性。诸如聚类和降维之类的过程会根据细胞的基...[作者空间]
动机 通常在单细胞RNA测序数据中观察到文库之间测序覆盖率的系统差异。它们通常是由细胞间的cDNA捕获或PCR扩增...[作者空间]
概述 本章概述了典型的scRNA-seq分析工作流程的框架（图1）。 随后将更详细地描述每个分析步骤。 实验设计 ...[作者空间]
背景介绍 Bioconductor项目的主要优势之一在于使用通用数据基础结构，该数据基础结构可实现跨越R包的相互操...[作者空间]
整体思路：细胞相互作用的复杂网络支配免疫系统与肿瘤细胞之间的互动，了解实体瘤的特定免疫细胞组成，对于预测患者对免疫...[作者空间]
Bioconductor软件包SingleCellExperiment提供了SingleCellExperimen...[作者空间]
library（Seurat） library(dplyr) library(clusterProfiler) l...[作者空间]
不同数据集联合分析 选择了通过四种技术产生的人胰岛细胞数据集：CelSeq（GSE81076) CelSeq2（G...[作者空间]
本文参考Satija Lab的seurat 包，网址https://satijalab.org/seurat 设置...[作者空间]
发表在2018年9月的NC, 文章是：Acquired cancer resistance to combinat...[作者空间]
