GSEA（Gene Set EnrichmentAnalysis），即基因集富集分析，无需设定阈值来区分上调下调基...[作者空间]
What：什么是GO和KEGG？ GO全称是Gene Ontology，它分为：细胞组分（cellular com...[作者空间]
生信宝典之前总结了一篇关于GSEA富集分析的推文——GSEA富集分析：从概念理解到界面实操 ，介绍了GSEA的定义...[作者空间]
参考：生信技能树 电脑卡住了 先做笔记吧。。。参考 生信技能树 和 小贝学生信[作者空间]
对样本进行分级后，通路的分析不适合传统的kegg和gsea分析，下面把单细胞的gsva分析带入tcga分析，原理一...[作者空间]
0.需求解读 左边是几个GO term，右边是基因。每个term一个颜色，基因的颜色按照logFC渐变。基因与te...[作者空间]
一、GO分析的理论知识 what is Gene Ontology（GO）? 基因"本体论"Gene Ontolo...[作者空间]
6月20号讲完上一期的线上直播课后，我回家呆了9天，亲三天，爱三天，爱答不理又三天，蹭完赶紧跑。家里新来了两只小狗...[作者空间]
Chord Diagram弦状图-用来画富集分析的结果 前面看的文献中，有一个很漂亮的圈图，https://mp....[作者空间]
KEGG分析 按照count数目进行KEGG count数目进行kegg,并且可视化 GSEA分析 GSEA与KE...[作者空间]
GO分析 GO分析有三个过程，GO_CC细胞组分，GO_BP生物过程, GO_MP分析功能，首先转换成ENTREZ...[作者空间]
一般做完差异基因，或者使用其他方法找到想要的biomarker时，想要知道这些基因的调控网络，或者哪些基因在调控网...[作者空间]
如前所说，过表达富集分析有不少缺点。因此以GSEA为代表的FCS方法也是人们所倾向的选择。接下来将简单了解下方法原...[作者空间]
题目出自【生信技能树】公众号文章：2011年的表达芯片分析和2019年的区别要求：走GEO标准分析流程分析GSE2...[作者空间]
第一：要下载相应的GSEA基因集 第二：关于GSEA 理解输入输出 1.需要输入一个geneList选取差异表达的...[作者空间]
