论文 Super-pangenome analyses highlight genomic diversity a...[作者空间]
OrthoVenn2 OrthoVenn2是一个网页版的基因家族聚类工具,它基于OrthoMCL。选择要分析的物种...[作者空间]
比较基因组分析,首先需要选定要比较的物种,然后下载这些物种的基因组数据。 基因组数据准备 数据准备1.基因结构注释...[作者空间]
Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs (BUSCO)是用于评估...[作者空间]
cafe自带的程序,只能单独标注扩增或者收缩的基因家族数。手工标注又很麻烦,所以我写了一个R程序,虽然图不够精致,...[作者空间]
synvisio在线工具 链接 https://synvisio.github.io/[https://synvi...[作者空间]
由于忙课题的原因,断更了好久,虽然断更的时间内学习到了很多东西,但细想一下还是记录在自己博客里比较好,方便自己查阅...[作者空间]
网上已经有很多教程,自己尝试梳理。 共线性分析,你会想到什么?基于蛋白编码基因1.1 MCScanX[https:...[作者空间]
JCVI,包含了太多的功能,但是我感觉好像又没有一个特别好的说明文档(小声bb,感谢唐老师的开发的好用工具) bl...[作者空间]
看我不如看【参考】 参考:WGDI | https://github.com/SunPengChuan/wgdi[...[作者空间]
不用说,又被锁定了呗,至今不知道为何,难道是因为翻译的文字太多?里面的网址太多,被认为违规?还是看公众号对应标题的...[作者空间]
大家经常在文献中看到非常好看的序列比对图,现在笔者将目前见过的最好看的序列比对图的作图方法作分享,希望对大家的科研...[作者空间]
ColinearScan是世界级共线性/多倍化/生物信息分析大牛/奠基人/发展人王希胤老师在北大读博开发的一款共线...[作者空间]
LAST依赖库安装 方法1:手动下载-自行编译 方法2:conda安装 Python版 MCScanX安装 初次调...[作者空间]
写在前面 没想到,上个选修课,准备示例数据和镜像上,竟然花了我三四天....主要原因还是,「网速太差」。搞七搞八,...[作者空间]
一、基本操作 1. 使用界面 可以注册后使用,点击upload即可上传树文件 2. 基本操作 右侧controls...[作者空间]
论文 GENESPACE: syntenic pan-genome annotations for eukaryo...[作者空间]
1 介绍 参考文献:Zhang Z . KaKs_calculator 3.0: Calculating sele...[作者空间]
比对到转录本,预测基因 使用TransDecoder将结果整理成evm输入格式 第一步整理后:[作者空间]
实验目的:比较基因组学,从基因组获取单拷贝基因,并构建有根的进化树,并估计分化时间,最终画出有分化时间的进化树实验...[作者空间]