一、GO分析的理论知识 what is Gene Ontology(GO)? 基因"本体论"Gene Ontolo...[作者空间]
一、新基因发掘 基于所选参考基因组序列,使用StringTie软件对Mapped Reads进行拼接,并与原有的基...[作者空间]
KEGG pathway 注释整理 获得KEGG注释 通过eggnog-mapper和interproscan两个...[作者空间]
目录写在前面功能注释数据库介绍方法一: 以KEGG的注释结果为主, 筛选出每个品种包含的特异通路及基因方法二: 利...[作者空间]
原文来自生信菜鸟团,又添加了三个配色! 备注: 参考http://www.biotrainee.com/threa...[作者空间]
刘小泽写于19.1.20-21要进行GO或者KEGG富集分析,就需要知道每个基因对应什么样的GO/KEGG分类,O...[作者空间]
刘小泽写于19.1.16+19.1.19随着不断地知识更新,之前不了解的东西开始变得熟悉,学习曲线就是这样 功能注...[作者空间]
背景 得到一个基因集以后,需要知道基因有哪些功能,参与哪些生物过程,只有理解了基因的功能以后,才能联系起来基因型与...[作者空间]
对于非模式生物或者无参考基因组的项目,经常需要进行基因的功能注释,而GO注释是基因功能注释的重要部分。有很多软件能...[作者空间]
Interpro数据库 Interpro是集成了蛋白质家族、结构域和功能位点的非冗余蛋白质特征序列数据库, Int...[作者空间]
有人说Y叔的clusterpofiler的GO注释结果和其他工具不一样,后来询问,发现分析物种是拟南芥。这就让我想...[作者空间]
关于GO 注释的心得体会 目前对于GO功能注释的思路有 以下常见的三种: 1、BLAST+InterProScan...[作者空间]
>library(ggplot2) #载入ggplot2 >data=read.table("GO.count.t...[作者空间]
InterProscan 是一个比较强大的核酸/蛋白序列注释程序。使用命令入下: tsv 输出格式如下: 很好,很...[作者空间]