原理和公式参考： https://www.jianshu.com/p/c7ba1aa543fe[https://w...[作者空间]

作物遗传育种需要发掘对农艺性状有重要贡献的QTL。某一重要农艺性状往往是由多个QTL调控。对这些QTL进行精...[作者空间]

本文转载自：Bionifarmer[https://www.cnblogs.com/jessepeng/p/143...[作者空间]

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常见的群体结构的分析方法有admixture分析、系统发生数分析以及主成分分析等。 1、admixture分析 R...[作者空间]

利用协方差矩阵，特征值和特征向量将高纬变量投影到数个低维变量的过程； PCA分析的过程就是从千万级别的SNP位点中...[作者空间]

Title: Distinct genetic architectures for phenotype means...[作者空间]

一般做完差异分析都会做这一步，目的是找到差异基因富集到的通路，进而与生物学意义联系起来。具体的统计方法很简单，这篇...[作者空间]

IntAssoplot包可以将GWAS结果和LD， 基因结构图整合在一起画出。介绍来自：https://githu...[作者空间]

1.MCscanMCscan绘制共线图MCscan需要准备cds.fasta和.gff注释文件cds.fasta文...[作者空间]

SnpEff文章 标题：A program for annotating and predicting the e...[作者空间]

Title: A genome-wide association study reveals that the g...[作者空间]

此视频来自B站，是非常好和全的的一个GWAS操作的视频，从开始准备软件下载，数据过滤，到最后的候选基因注释。GWA...[作者空间]

1 使用plink挑选个体 注意bsz.txt是要提取的样本名，为两列。[作者空间]

1. 软件简介 CFVisual_V2.1软件是一款借助Python语言的matplotlib库和PySi...[作者空间]

我已经通过Gemma得到了关联分析的结果，如下。 prefix.log.txt 中包含了一个总的PVE，这不是我们...[作者空间]

如果说别人画图是折腾自己，那我画图可能就是折腾自己兼折腾群主.......首先在这里感谢何大哥哈（知乎：hewm2...[作者空间]

本文利用99085个高质量SNP 通过STRUCTURE，PCA和neighbour-joining tree的群...[作者空间]

使用CMplot包绘制环形曼哈度图 安装并加载所需R包 基本用法 常用参数 加载并查看示数据 基本数据格式： 默认...[作者空间]

GWAS和GS的第20篇学习笔记，建议阅读原始英文文献（有些点看英文更简单），翻译能力有限做不到信达雅，数组基础水...[作者空间]