上一期提到使用exomePeak2进行m6A的Peak Calling，结果如下，每个样本一个结果： ├── AD...[作者空间]
m6A图文复现已经更新到第五期了群里还是有非常多的小伙伴在问哪个步骤用哪个软件，在这里，我给出一张m6A分析的常规...[作者空间]
在上一期中我们得到hisat2的比对结果，现在一起来看下比对情况。 一，比对结果解读 比对结果文件如下，每一个样本...[作者空间]
在上一期中我们得到了cleandata后，先使用bowtie2与NCBI的rRNA的序列进行比对，进行了去除rRN...[作者空间]
circm6A是可以进行circRNA识别和m6A检测的软件。软件地址：https://github.com/ca...[作者空间]
在上一期中我们得到了cleandata，接下来是要比对到参考基因上进行比对过程的分析。一般来说，在比对之前，我们可...[作者空间]
上一篇文章我们提到作者有非常好的代码资源，但是数据没有权限下载。因此，我又重新找了一篇文献，使用这个文章的数据来进...[作者空间]
1.文献信息 标题：Genetic drivers of m6A methylation in human bra...[作者空间]
文章信息 文献标题：trumpet: transcriptome-guided quality assessmen...[作者空间]
m6A RNA甲基化是最常见、最丰富的真核生物mRNA转录后修饰。研究表明，m6A 在不同组织，细胞系中是一个复杂...[作者空间]
看到可视化的包，真的停不下来，就想先翻译一边先。 参考链接 APLS 全称 AnaLysis routines f...[作者空间]
链接来源 一切版权来源参考链接：此处只是用来记录和不能出去的情况。 Tutorial: Normalization...[作者空间]
欢迎关注”生信修炼手册”! 在chip_seq数据分析中，通常会对peak区域在基因组上的分布进行探究，查看其分布...[作者空间]
我经常和别人说 50% 高通量数据的后期分析概括一下都是各种位置之间的统计计算，因为但凡分析有参数据就会把所有信息...[作者空间]
需要的是V17，所以要提取第17列出来计算每个位置出现的频率，然后用于画饼图流程：[作者空间]
1、ATCG含量计算 来源我在学习Modern Statistics for Modern Biology 此文中...[作者空间]
安装： install.packages("devtools") library("devtools") sour...[作者空间]
MACS的自述文件（2.1.2） 运行 结果 介绍 随着测序技术的改进，染色质免疫沉淀，然后进行高通量测序（ChI...[作者空间]
文章：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4357668/ ...[作者空间]
文章：https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186...[作者空间]
