题目:对DEseq2差异分析得到的差异基因进行GO富集。 目的:旨在对基因和蛋白质功能进行限定和描述的。 内容:1...[作者空间]
GO富集分析相信大家都不陌生,在很多的SCI文章里面都会看到。相信大家应该都见过像下面这样的气泡图或者柱形图。 前...[作者空间]
pacbio三代全长转录组数据分析isoseq31 参考官方文档及其他教程,包括原理、流程等 2 软件安装主要参考...[作者空间]
本节概览:1.STRING数据库基本介绍2.STRING R语言版——STRINGdb的使用:STRINGdb数据...[作者空间]
如果所研究的物种有组装注释质量较好基因组序列,且和该基因组序列比对效率较高,那么可以采用有参转录组的分析策略,直接...[作者空间]
当你在研究一个基因时,你应该首先应该知道这个基因的研究的进展,如该基因是否是个与癌症相关基因,它在各种细胞系或者组...[作者空间]
写在前面:经常做转录组分析,就是把差异基因搞个火山图和Venn图看各组差异基因的共有和特有情况。看见有个比较好的选...[作者空间]
蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)是指两个或两个以上的蛋白...[作者空间]
1. Gene_ID转换 手动把差异表格中基因那一列(如gene-Q0020,gene-替换掉 ),在gene_i...[作者空间]
前言: 我发现有些童鞋在回复关键词时,如果没有得到对应的回复内容,也许是你输入的关键词错误了,请你重新输入即可。我...[作者空间]
写在前面 前段时间,推过两个教程,分别是:1.《零基础快速完成基因功能注释 / GO / KEGG / PFAM....[作者空间]
写在前面 很多时候,我们会看到一些文稿,上来就是“我研究的物种如何如何重要”。其中,最有说服力的,或许就是,基于“...[作者空间]
在microRNA的研究中,生物信息学发挥越来越重要的作用,以下是microRNA相关的数据库与预测、功能分析软件...[作者空间]
NCBI网站找到target gene 的CDS区域 第一步:打开菜单栏,下拉到Gene,在搜索框输入目标基因GS...[作者空间]
转自:https://mp.weixin.qq.com/s/Yt9HwCrvsz4gAkieTWYjRQ[http...[作者空间]
建库 蛋白比对 提取ID seqkit fx2tab swiss-prot.tab -n -i >id.fa bl...[作者空间]
参考教程: Griffith Lab tutorial[https://rnabio.org/course/] r...[作者空间]
凡是做分子机制的研究,必做分子(mRNA/lnc/circ/miRNA/piRNA ...)的过表达敲低实验,观察...[作者空间]
1、创建 BioProject 号和 BioSample 号 对某一个物种进行了基因组测序,则申请 BioProj...[作者空间]
简写 RPKM: Reads Per Kilobase of exon model per Million map...[作者空间]